Original Title: Screening and Identification of Thermophilic Lactic Acid Bacteria Producing Antibacterial Substances Determined by OMP Analysis
Source: li01.tci-thaijo.org
Disclaimer: Summary generated by AI based on the provided document. Please refer to the original paper for full scientific accuracy.

ការពិនិត្យចម្រាញ់ និងការកំណត់អត្តសញ្ញាណបាក់តេរីអាស៊ីតឡាក់ទិកធន់នឹងកម្តៅដែលផលិតសារធាតុប្រឆាំងបាក់តេរី កំណត់ដោយការវិភាគ OMP

ចំណងជើងដើម៖ Screening and Identification of Thermophilic Lactic Acid Bacteria Producing Antibacterial Substances Determined by OMP Analysis

អ្នកនិពន្ធ៖ Melaku Alemu (Ethiopian Agricultural Research Organization), Damrussiri Kraykaw (Japan International Research Center for Agricultural Sciences), Sadahiro Ohmomo (Japan International Research Center for Agricultural Sciences), Sunee Nitisinprasert (Kasetsart University)

ឆ្នាំបោះពុម្ព៖ 2003, Kasetsart J. (Nat. Sci.)

វិស័យសិក្សា៖ Microbiology

១. សេចក្តីសង្ខេបប្រតិបត្តិ (Executive Summary)

បញ្ហា (The Problem)៖ ការសិក្សានេះផ្តោតលើការស្វែងរក និងកំណត់អត្តសញ្ញាណបាក់តេរីអាស៊ីតឡាក់ទិក (LAB) ដែលអាចផលិតសារធាតុប្រឆាំងបាក់តេរីដ៏មានប្រសិទ្ធភាព ដើម្បីប្រើប្រាស់ជាសារធាតុអភិរក្សជីវសាស្ត្រក្នុងចំណីអាហារ និងការផ្អាប់ចំណីសត្វ (Silage)។

វិធីសាស្ត្រ (The Methodology)៖ អ្នកស្រាវជ្រាវបានធ្វើការពិនិត្យចម្រាញ់បាក់តេរី LAB ចំនួន ៤៦ ប្រភេទ ដោយប្រើប្រាស់វិធីសាស្ត្រសរីរវិទ្យា ជីវគីមី និងម៉ូលេគុល ព្រមទាំងប្រៀបធៀបសកម្មភាពរបស់វាទៅនឹងប្រព័ន្ធម៉ូដែលអាស៊ីតសរីរាង្គ។

លទ្ធផលសំខាន់ៗ (The Verdict)៖

២. ការវិភាគលើប្រសិទ្ធភាព និងដែនកំណត់ (Performance & Constraints)

វិធីសាស្ត្រ (Method) គុណសម្បត្តិ (Pros) គុណវិបត្តិ (Cons) លទ្ធផលគន្លឹះ (Key Result)
Culture Supernatants (CS) Evaluation
ការវាយតម្លៃលើទឹកបណ្តុះបាក់តេរី (CS)
មានផ្ទុកសារធាតុសកម្មទាំងអស់រួមទាំងអាស៊ីតឡាក់ទិក អាស៊ីតអាសេទិក និងសមាសធាតុជីវសកម្មផ្សេងៗ (ដូចជា បាក់តេរីយ៉ូស៊ីន) ដែលផ្តល់សកម្មភាពប្រឆាំងបាក់តេរីយ៉ាងខ្លាំងក្លា និងទូលំទូលាយ។ ពិបាកក្នុងការកំណត់ថាតើសារធាតុណាមួយជាក់លាក់ដែលដើរតួនាទីចម្បងក្នុងការទប់ស្កាត់បាក់តេរី ប្រសិនបើមិនមានការបន្សុទ្ធបន្តបន្ទាប់។ បង្ហាញសកម្មភាពទប់ស្កាត់កម្រិត 400 AU/ml ប្រឆាំងនឹងបាក់តេរីបង្កជំងឺ E. coli និង Salmonella
Organic Acid Model System Performance (OMP)
ការវិភាគប្រព័ន្ធម៉ូដែលអាស៊ីតសរីរាង្គ (OMP)
អនុញ្ញាតឱ្យអ្នកស្រាវជ្រាវកំណត់យ៉ាងច្បាស់នូវប្រសិទ្ធភាពប្រឆាំងបាក់តេរីដែលបានមកពីអាស៊ីតសរីរាង្គ (ឡាក់ទិក និងអាសេទិក) នៅកម្រិត pH ជាក់លាក់មួយដោយឡែកពីសារធាតុផ្សេង។ ខ្វះឥទ្ធិពលរួមបញ្ចូលគ្នានៃសមាសធាតុជីវសកម្មផ្សេងៗទៀតដែលបាក់តេរីផលិតដោយធម្មជាតិ ដែលធ្វើឱ្យប្រសិទ្ធភាពទប់ស្កាត់មានកម្រិតទាបជាងធម្មជាតិ។ បង្ហាញសកម្មភាពទប់ស្កាត់ត្រឹមតែ 200 AU/ml ដែលមានន័យថាទាបជាងទឹកបណ្តុះបាក់តេរីធម្មជាតិ (CS) ដល់ទៅ ៥០%។

ការចំណាយលើធនធាន (Resource Cost)៖ ការសិក្សានេះទាមទារឧបករណ៍មន្ទីរពិសោធន៍អតិសុខុមជីវសាស្ត្រ និងជីវសាស្ត្រម៉ូលេគុលកម្រិតខ្ពស់ រួមទាំងឧបករណ៍វិភាគគីមីផងដែរ។

៣. ការពិនិត្យសម្រាប់បរិបទកម្ពុជា/អាស៊ីអាគ្នេយ៍

ភាពលំអៀងនៃទិន្នន័យ (Data Bias)៖

ការសិក្សានេះត្រូវបានធ្វើឡើងលើបាក់តេរី LAB ចំនួន ៤៦ ប្រភេទដែលបានបំបែកចេញពីចំណីសត្វផ្អាប់ (Silage) នៅក្នុងប្រទេសថៃ ជាមួយនឹងបាក់តេរីគោលដៅជាប្រភេទ ATCC និងបាក់តេរីដែលបំបែកពីពោះវៀនមាន់។ សម្រាប់ប្រទេសកម្ពុជា ប្រព័ន្ធអេកូឡូស៊ីអតិសុខុមប្រាណនៅក្នុងចំណីសត្វផ្អាប់ក្នុងស្រុកអាចមានភាពខុសគ្នាបន្តិចបន្តួចដោយសារអាកាសធាតុ។ ដូច្នេះ ការសិក្សាស្រាវជ្រាវដើម្បីស្វែងរកបាក់តេរីក្នុងស្រុកកម្ពុជាផ្ទាល់ អាចនឹងផ្តល់នូវសារធាតុអភិរក្សជីវសាស្ត្រដែលកាន់តែស័ក្តិសម។

លទ្ធភាពនៃការអនុវត្ត (Applicability)៖

វិធីសាស្ត្រ និងលទ្ធផលនៃការសិក្សានេះមានសារៈសំខាន់ និងអាចអនុវត្តបានយ៉ាងល្អសម្រាប់វិស័យកសិកម្ម និងការកែច្នៃម្ហូបអាហារដែលកំពុងរីកចម្រើននៅកម្ពុជា។

ការទាញយកអត្ថប្រយោជន៍ពីបាក់តេរី LAB ធន់នឹងកម្តៅ អាចជួយលើកកម្ពស់ស្តង់ដារសុវត្ថិភាពចំណីអាហារ និងផលិតភាពកសិកម្មរបស់កម្ពុជា ព្រមទាំងជំរុញវិធីសាស្ត្រអភិរក្សតាមបែបជីវសាស្ត្រប្រកបដោយចីរភាព។

៤. ផែនការសកម្មភាពសម្រាប់និស្សិត (Actionable Roadmap)

ដើម្បីអនុវត្តតាមការសិក្សានេះ និស្សិតគួរអនុវត្តតាមជំហានខាងក្រោម៖

  1. អនុវត្តបច្ចេកទេសបំបែក និងបណ្តុះបាក់តេរី LAB: ចាប់ផ្តើមដោយការប្រមូលសំណាកពីអាហារផ្អាប់ក្នុងស្រុក ឬចំណីសត្វផ្អាប់កម្ពុជា ហើយអនុវត្តបច្ចេកទេសអតិសុខុមជីវសាស្ត្រមូលដ្ឋានដូចជា Serial dilution, ការបណ្តុះលើមជ្ឈដ្ឋាន MRS agar និងការធ្វើ Gram staining ដើម្បីកំណត់រូបរាងបាក់តេរី។
  2. រៀនធ្វើតេស្តសកម្មភាពប្រឆាំងបាក់តេរី (Antibacterial Screening): រៀបចំការធ្វើតេស្តដោយប្រើវិធីសាស្ត្រ Spot-on-Lawn ប្រឆាំងនឹងបាក់តេរីគោលដៅ (ឧ. E. coli) ដោយវាស់ស្ទង់រង្វង់ទប់ស្កាត់ (Inhibition zones) និងគណនាជាឯកតា Arbitrary Units (AU/ml)
  3. ស្វែងយល់ពីប្រព័ន្ធវិភាគម៉ូដែល (OMP Analysis): រៀនពីរបៀបរចនាប្រព័ន្ធ OMP (Organic acid Model system Performance) ដោយរៀបចំកំហាប់អាស៊ីត និងកម្រិត pH ឱ្យដូចទៅនឹងទឹកបណ្តុះបាក់តេរី ដើម្បីបញ្ជាក់ថាតើមានវត្តមានសារធាតុប្រឆាំងបាក់តេរីផ្សេងទៀត (ដូចជា Bacteriocins) ក្រៅពីអាស៊ីតដែរឬទេ។
  4. ពង្រឹងជំនាញលើការកំណត់អត្តសញ្ញាណតាមរយៈម៉ូលេគុល: សហការជាមួយសាស្ត្រាចារ្យ ដើម្បីអនុវត្តការប្រើប្រាស់ម៉ាស៊ីន PCR សម្រាប់ពង្រីកហ្សែន 16S rRNA និងរៀនអានលទ្ធផល DNA Sequencing ដោយប្រើកម្មវិធីដូចជា BLAST ដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណប្រភេទបាក់តេរីឱ្យបានច្បាស់លាស់។
  5. សាកល្បងក្នុងគម្រោងស្រាវជ្រាវខ្នាតតូច (Pilot Project): ចាប់ផ្តើមគម្រោងស្រាវជ្រាវដោយសាកល្បងប្រើប្រាស់បាក់តេរី LAB ដែលបានរកឃើញ យកទៅអនុវត្តផ្ទាល់ជាមួយផលិតផលសាច់ផ្អាប់ ឬជ្រក់ ដើម្បីវាយតម្លៃពីប្រសិទ្ធភាពក្នុងការទប់ស្កាត់បាក់តេរីធ្វើឱ្យខូចចំណីអាហារនៅក្នុងស្ថានភាពពិត។

៥. វាក្យសព្ទបច្ចេកទេស (Technical Glossary)

ពាក្យបច្ចេកទេស ការពន្យល់ជាខេមរភាសា (Khmer Explanation) និយមន័យសាមញ្ញ (Simple Definition)
Thermophilic (បាក់តេរីធន់នឹងកម្ដៅ) ប្រភេទអតិសុខុមប្រាណដែលលូតលាស់បានយ៉ាងល្អនៅក្នុងមជ្ឈដ្ឋានដែលមានសីតុណ្ហភាពខ្ពស់ជាងធម្មតា (ឧទាហរណ៍ ៤៥ ទៅ ៥០ អង្សាសេ) ដែលជាលក្ខណៈអំណោយផលសម្រាប់ការផ្អាប់ចំណីអាហារនៅតំបន់ក្ដៅដូចជាប្រទេសកម្ពុជា។ ដូចជាមនុស្សដែលចូលចិត្ត និងអាចធ្វើការបានយ៉ាងល្អនៅក្រោមកម្ដៅថ្ងៃក្ដៅខ្លាំង ក្នុងពេលដែលអ្នកដទៃមិនអាចទ្រាំបាន។
Lactic Acid Bacteria (បាក់តេរីអាស៊ីតឡាក់ទិក) ក្រុមបាក់តេរីដែលបំប្លែងកាបូអ៊ីដ្រាត (ជាតិស្ករ) ទៅជាអាស៊ីតឡាក់ទិក ជួយបញ្ចុះកម្រិត pH ក្នុងអាហារ និងបង្កើតសារធាតុទប់ស្កាត់ការលូតលាស់របស់បាក់តេរីចង្រៃ ដែលគេប្រើប្រាស់ជាទូទៅក្នុងការធ្វើម្ហូបផ្អាប់ (ដូចជា ជ្រក់ ផ្អក ណែម)។ ដូចជាចុងភៅដែលប្រែក្លាយស្ករទៅជាទឹកខ្មេះ ដើម្បីជួយថែរក្សាម្ហូបអាហារកុំឱ្យឆាប់ខូច។
Cell-free culture supernatants (CS) (ទឹកបណ្តុះបាក់តេរីគ្មានកោសិកា) សារធាតុរាវដែលនៅសេសសល់បន្ទាប់ពីការបណ្តុះបាក់តេរី ហើយត្រូវបានគេយកកោសិកាបាក់តេរីចេញអស់ (តាមរយៈការបង្វិលល្បឿនលឿន) ដែលក្នុងនោះមានផ្ទុកនូវសារធាតុសកម្មផ្សេងៗ (ដូចជាអាស៊ីត និងបាក់តេរីយ៉ូស៊ីន) ដែលបាក់តេរីបានបញ្ចេញមក។ ដូចជាទឹកស៊ុបដែលគេស្រង់យកសាច់ និងឆ្អឹងចេញអស់ នៅសល់តែទឹកដែលមានរសជាតិ និងជីវជាតិរលាយចូលពីសាច់។
OMP Analysis (ការវិភាគប្រព័ន្ធម៉ូដែលអាស៊ីតសរីរាង្គ) វិធីសាស្ត្របង្កើតសូលុយស្យុងសិប្បនិម្មិតដែលមានបរិមាណអាស៊ីត និងកម្រិត pH ដូចគ្នាបេះបិទទៅនឹងទឹកបណ្តុះបាក់តេរី (CS) ដើម្បីធ្វើតេស្តប្រៀបធៀប និងបញ្ជាក់ថាអំពើទប់ស្កាត់បាក់តេរីគឺបណ្តាលមកពីអាស៊ីតតែមួយមុខ ឬមានសារធាតុផ្សេងទៀតចូលរួម។ ដូចជាការបង្កើត "ថ្នាំក្លែងក្លាយ" ដែលមានរសជាតិ និងពណ៌ដូចថ្នាំពិត ដើម្បីយកមកប្រៀបធៀបមើលថាតើថ្នាំពិតពិតជាមានប្រសិទ្ធភាពព្យាបាលដោយសារធាតុផ្សំកម្រិតខ្ពស់របស់វាឬអត់។
Arbitrary units (AU/ml) (ឯកតាតាមការកំណត់ជាទូទៅ) រង្វាស់ដែលប្រើដើម្បីបញ្ជាក់ពីកម្រិតសកម្មភាពរបស់សារធាតុប្រឆាំងបាក់តេរី ដោយគណនាផ្អែកលើកម្រិតនៃការពនឺ (Dilution) ខ្ពស់បំផុតដែលនៅតែអាចបង្កើតរង្វង់ទប់ស្កាត់ការលូតលាស់របស់បាក់តេរីគោលដៅបាន។ ដូចជាការវាស់កម្លាំងថ្នាំពុល ដោយលាយទឹកកាន់តែរាវទៅៗ រហូតដល់ចំណុចដែលវាមិនអាចសម្លាប់សត្វល្អិតបាន ដើម្បីដឹងថាវាខ្លាំងប៉ុណ្ណា។
Spot-on-lawn method (វិធីសាស្ត្រន្តក់លើស្មៅបាក់តេរី) បច្ចេកទេសមន្ទីរពិសោធន៍ដែលគេលាបបាក់តេរីគោលដៅឱ្យដុះពេញផ្ទៃចាន Petri (មើលទៅដូចជាវាលស្មៅ) រួចបន្តក់សារធាតុរាវដែលចង់ធ្វើតេស្តពីលើ ដើម្បីមើលថាតើមានរង្វង់ថ្លា (Inhibition zone) ដែលបញ្ជាក់ពីការងាប់របស់បាក់តេរីឬទេ។ ដូចជាការបន្តក់ទឹកថ្នាំសម្លាប់ស្មៅទៅលើវាលស្មៅ ប្រសិនបើស្មៅត្រង់នោះងាប់ក្លាយជារង្វង់ដីទទេ នោះបញ្ជាក់ថាទឹកថ្នាំនោះពិតជាមានប្រសិទ្ធភាពសម្លាប់ស្មៅ។
Bacteriocin (បាក់តេរីយ៉ូស៊ីន) ប្រូតេអ៊ីន ឬប៉ិបទីតតូចៗដែលផលិតដោយបាក់តេរីមួយចំនួន (ដូចជាបាក់តេរីអាស៊ីតឡាក់ទិក) ដែលមានសមត្ថភាពសម្លាប់ ឬទប់ស្កាត់ការលូតលាស់របស់បាក់តេរីបង្កជំងឺផ្សេងទៀតដែលនៅក្បែរវា ដោយមិនប៉ះពាល់ដល់កោសិកាវាផ្ទាល់។ ដូចជាអាវុធគីមីការពារខ្លួនដែលកុលសម្ព័ន្ធមួយបានបង្កើតឡើង ដើម្បីវាយប្រហារសត្រូវដែលព្យាយាមមកដណ្តើមទឹកដីរបស់ពួកគេ។
16S rRNA gene sequencing (ការកំណត់លំដាប់ហ្សែន 16S rRNA) បច្ចេកទេសម៉ូលេគុលដែលប្រើសម្រាប់អានលំដាប់ DNA នៃហ្សែន 16S rRNA របស់បាក់តេរី ដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណប្រភេទ និងវង្សត្រកូលរបស់វាឱ្យបានច្បាស់លាស់ ដោយសារហ្សែននេះមានលក្ខណៈពិសេសប្រចាំប្រភេទនីមួយៗមិនងាយប្រែប្រួល។ ដូចជាការស្កេនស្នាមមេដៃរបស់មនុស្ស ដើម្បីដឹងច្បាស់ថាគាត់ជាអ្នកណា និងមានប្រវត្តិគ្រួសារមកពីណា។
Homofermentative (ការផ្អាប់បង្កើតសារធាតុទោល) លក្ខណៈនៃការធ្វើមេតាបូលីសរបស់បាក់តេរីមួយចំនួនដែលបំប្លែងកាបូអ៊ីដ្រាត (ជាតិស្ករ) ទៅជាផលិផលចុងក្រោយតែមួយមុខគត់ គឺអាស៊ីតឡាក់ទិក ក្នុងបរិមាណច្រើន (ច្រើនជាង ៨៥%) ។ ដូចជារោងចក្រដែលយកវត្ថុធាតុដើម (ឈើ) មកផលិតចេញជាផលិតផលតែមួយមុខគត់ (ក្រដាស) ដោយមិនមានផលិតផលបន្ទាប់បន្សំផ្សេងទៀត។

៦. ប្រធានបទពាក់ព័ន្ធ (Further Reading)

អត្ថបទដែលបានបោះពុម្ពនៅលើ KhmerResearch ដែលទាក់ទងនឹងប្រធានបទនេះ៖

ប្រធានបទ និងសំណួរស្រាវជ្រាវដែលទាក់ទងនឹងឯកសារនេះ ដែលអ្នកអាចស្វែងរកបន្ថែម៖