Original Title: การประเมินความต้านทานของข้าวพันธุ์ไทยต่อเชื้อรา Bipolaris oryzae สาเหตุโรคใบจุดสีน้ำตาล
Source: doi.org/10.14456/thaidoa-agres.2023.22
Disclaimer: Summary generated by AI based on the provided document. Please refer to the original paper for full scientific accuracy.

ការវាយតម្លៃភាពធន់នៃពូជស្រូវថៃចំពោះផ្សិត Bipolaris oryzae ដែលជាភ្នាក់ងារបង្កជំងឺអុចត្នោត

ចំណងជើងដើម៖ การประเมินความต้านทานของข้าวพันธุ์ไทยต่อเชื้อรา Bipolaris oryzae สาเหตุโรคใบจุดสีน้ำตาล

អ្នកនិពន្ធ៖ Manunchaya Chuchiw (Department of Plant Pathology, Kasetsart University), Surapong Dumrongkittikule (Department of Horticulture, Kasetsart University), Payorm Cobelli (Division of Rice Research and Development, Rice Department), Jintana Unartngam (Department of Plant Pathology, Kasetsart University)

ឆ្នាំបោះពុម្ព៖ 2023 Thai Agricultural Research Journal

វិស័យសិក្សា៖ Plant Pathology

១. សេចក្តីសង្ខេបប្រតិបត្តិ (Executive Summary)

បញ្ហា (The Problem)៖ ជំងឺអុចត្នោតលើស្រូវបង្កឡើងដោយផ្សិត Bipolaris oryzae ដែលធ្វើឱ្យប៉ះពាល់ដល់ទិន្នផល និងគុណភាពគ្រាប់ពូជ ខណៈភាពធន់របស់ពូជស្រូវអាចប្រែប្រួលនៅពេលមានប្រភេទមេរោគថ្មីរាលដាលក្នុងតំបន់។ ការសិក្សានេះមានគោលបំណងវាយតម្លៃភាពធន់នៃពូជស្រូវចំពោះផ្សិតនេះ ដើម្បីផ្តល់ព័ត៌មានសម្រាប់ការបង្កាត់ពូជនាពេលអនាគត។

វិធីសាស្ត្រ (The Methodology)៖ ការសិក្សានេះប្រើប្រាស់ការវិភាគហ្សែនដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណមេរោគ និងការចាក់បញ្ចូលមេរោគសាកល្បងលើពូជស្រូវក្នុងផ្ទះកញ្ចក់ដើម្បីវាយតម្លៃកម្រិតនៃភាពធន់។

លទ្ធផលសំខាន់ៗ (The Verdict)៖

២. ការវិភាគលើប្រសិទ្ធភាព និងដែនកំណត់ (Performance & Constraints)

វិធីសាស្ត្រ (Method) គុណសម្បត្តិ (Pros) គុណវិបត្តិ (Cons) លទ្ធផលគន្លឹះ (Key Result)
Molecular Identification & Phylogenetic Analysis
ការកំណត់អត្តសញ្ញាណតាមរយៈហ្សែនម៉ូលេគុល និងវិភាគប្រវត្តិហ្សែន
មានភាពសុក្រឹតខ្ពស់បំផុតក្នុងការបញ្ជាក់ប្រភេទមេរោគ និងអាចស្វែងយល់ពីបំរែបំរួលនៃសេនេទិចមេរោគនៅក្នុងតំបន់។ ទាមទារឧបករណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ទំនើប អ្នកជំនាញកម្រិតខ្ពស់ ចំណាយច្រើន និងត្រូវការពេលវេលាយូរក្នុងការអនុវត្ត។ កំណត់បានយ៉ាងច្បាស់នូវអត្តសញ្ញាណផ្សិតទាំង ៣ ថាជាប្រភេទ Bipolaris oryzae ជាមួយនឹងកម្រិតទំនុកចិត្តការចាត់ក្រុម (Bootstrap) ១០០%។
Greenhouse Resistance Screening
ការវាយតម្លៃភាពធន់នៃពូជស្រូវនៅក្នុងផ្ទះកញ្ចក់
ឆ្លុះបញ្ចាំងពីអន្តរកម្មផ្ទាល់រវាងរុក្ខជាតិ និងមេរោគ ដែលផ្តល់ទិន្នន័យជាក់ស្តែង និងអាចទុកចិត្តបានសម្រាប់ការបង្កាត់ពូជ។ ត្រូវការទីតាំងធំទូលាយសម្រាប់ការដាំដុះ ហើយលទ្ធផលអាចរងឥទ្ធិពលពីកត្តាបរិស្ថានមួយចំនួនប្រសិនបើមិនមានការគ្រប់គ្រងល្អ។ រកឃើញពូជ Homsuphan មានភាពធន់ (R/MR) និងពូជ RD29 និងពូជដំណើបខ្មៅងាយរងគ្រោះខ្លាំង (HS) ក្នុងចំណោម ៧២ ពូជ។
UPGMA Cluster Analysis
ការវិភាគចង្កោមចំណាត់ថ្នាក់ទិន្នន័យ UPGMA
ជួយចាត់ថ្នាក់ក្រុមពូជស្រូវតាមកម្រិតនៃភាពធន់បានយ៉ាងច្បាស់លាស់ និងងាយស្រួលក្នុងការបង្ហាញទិន្នន័យវិភាគសរុប។ ភាពត្រឹមត្រូវនៃលទ្ធផលពឹងផ្អែកទាំងស្រុងទៅលើការប្រមូលទិន្នន័យវាយតម្លៃកម្រិតជំងឺ (Disease Index) ដែលអាចមានការវាយតម្លៃខុសពីអ្នកសង្កេត។ បែងចែកពូជស្រូវទាំង ៧២ ជា ៦ ក្រុមដោយមានកម្រិតទំនាក់ទំនងនៃចង្កោម (cophenetic correlation) ០.៧៧៨៧។

ការចំណាយលើធនធាន (Resource Cost)៖ ការសិក្សានេះទាមទារការវិនិយោគច្រើនលើសម្ភារៈមន្ទីរពិសោធន៍ជីវម៉ូលេគុលកម្រិតខ្ពស់ និងទីតាំងដាំដុះសាកល្បងដែលអាចគ្រប់គ្រងបរិស្ថានបាន (ផ្ទះកញ្ចក់)។

៣. ការពិនិត្យសម្រាប់បរិបទកម្ពុជា/អាស៊ីអាគ្នេយ៍

ភាពលំអៀងនៃទិន្នន័យ (Data Bias)៖

ការសិក្សានេះប្រមូលផ្តុំទៅលើពូជស្រូវក្នុងស្រុករបស់ប្រទេសថៃទាំង ៧២ ពូជ និងមេរោគផ្សិតដែលប្រមូលបានពីខេត្តចំនួន៣ក្នុងប្រទេសថៃប៉ុណ្ណោះ។ សម្រាប់កម្ពុជា ទិន្នន័យនេះអាចមានដែនកំណត់ ព្រោះពូជស្រូវកម្ពុជា (ដូចជា ផ្ការំដួល ស្រូវសែនក្រអូប) មានហ្សែនខុសគ្នា ហើយប្រភេទមេរោគ Bipolaris oryzae ក្នុងស្រុកអាចមានការវិវត្តន៍ឬបំរែបំរួលផ្សេងពីថៃ។ ការធ្វើតេស្តស្រដៀងគ្នានេះដោយផ្ទាល់នៅកម្ពុជា គឺជារឿងចាំបាច់បំផុតដើម្បីបញ្ជាក់ពីកម្រិតភាពធន់នៃពូជស្រូវក្នុងស្រុកពិតប្រាកដ។

លទ្ធភាពនៃការអនុវត្ត (Applicability)៖

វិធីសាស្ត្រវាយតម្លៃដែលប្រើប្រាស់ក្នុងការស្រាវជ្រាវនេះ គឺមានសារៈសំខាន់ និងអាចយកមកអនុវត្តបានយ៉ាងល្អដើម្បីពង្រឹងកម្មវិធីបង្កាត់ពូជស្រូវនៅប្រទេសកម្ពុជា។

ការបន្សាំវិធីសាស្ត្រនេះមកប្រើនៅកម្ពុជា នឹងជួយពន្លឿនការបង្កើតពូជស្រូវធន់នឹងជំងឺ ធានាបាននូវទិន្នផលខ្ពស់ និងកាត់បន្ថយការពឹងផ្អែកទៅលើការប្រើប្រាស់ថ្នាំសម្លាប់ផ្សិតគីមីដែលប៉ះពាល់ដល់បរិស្ថាន។

៤. ផែនការសកម្មភាពសម្រាប់និស្សិត (Actionable Roadmap)

ដើម្បីអនុវត្តតាមការសិក្សានេះ និស្សិតគួរអនុវត្តតាមជំហានខាងក្រោម៖

  1. រៀនពីបច្ចេកទេសបណ្តុះ និងកំណត់អត្តសញ្ញាណមេរោគ (Morphological ID): និស្សិតត្រូវហ្វឹកហាត់ពីការបំបែកមេរោគផ្សិតចេញពីស្លឹកស្រូវដែលមានជំងឺ យកមកបណ្តុះលើមជ្ឈដ្ឋាន PDA media និងកំណត់អត្តសញ្ញាណរាងស្ព័រផ្សិតតាមរយៈ Compound Microscope
  2. អនុវត្តបច្ចេកទេសវិភាគជីវម៉ូលេគុលកម្រិតខ្ពស់ (Molecular Techniques): ត្រូវសិក្សាពីវិធីសាស្ត្រចម្រាញ់យក DNA របស់ផ្សិត និងការពង្រីកហ្សែនដោយប្រើម៉ាស៊ីន PCR ជាមួយនឹង Primers ជាក់លាក់ចំនួន ៣ មុខគឺ ITS rDNA, 28S rDNA និង GAPDH
  3. វិភាគទិន្នន័យសេនេទិច និងគូរប្រវត្តិហ្សែន (Phylogenetic Analysis): ប្រើប្រាស់កម្មវិធីកុំព្យូទ័រដូចជា MEGA-X ដើម្បីតម្រៀបលំដាប់ហ្សែន (Sequence alignment) និងបង្កើតមែកធាងប្រវត្តិសាស្ត្រហ្សែន (Phylogenetic tree) ដើម្បីកំណត់ពូជមេរោគឱ្យបានច្បាស់លាស់។
  4. អនុវត្តការវាយតម្លៃភាពធន់នៅក្នុងផ្ទះកញ្ចក់ (Resistance Screening): រៀបចំការពិសោធន៍ដោយចាក់បញ្ចូលមេរោគទៅលើកូនស្រូវ និងរៀនពីរបៀបវាយតម្លៃសន្ទស្សន៍ជំងឺ Disease Index តាមស្តង់ដារវាយតម្លៃរបស់វិទ្យាស្ថានអន្តរជាតិ IRRI
  5. ចងក្រងទិន្នន័យ និងវិភាគស្ថិតិចង្កោម (Cluster Analysis): ប្រមូលទិន្នន័យកម្រិតជំងឺទាំងអស់ ហើយប្រើប្រាស់កម្មវិធីកុំព្យូទ័រ PAST version 4.02 ដើម្បីវិភាគចាត់ថ្នាក់ក្រុមទិន្នន័យតាមវិធីសាស្ត្រ UPGMA cluster analysis សារជាថ្មីដើម្បីរកពូជធន់ពិតប្រាកដសម្រាប់ណែនាំដល់កសិករ។

៥. វាក្យសព្ទបច្ចេកទេស (Technical Glossary)

ពាក្យបច្ចេកទេស ការពន្យល់ជាខេមរភាសា (Khmer Explanation) និយមន័យសាមញ្ញ (Simple Definition)
Isolate (អ៊ីសូឡាត / វត្ថុសំណាកមេរោគ) ជាមេរោគផ្សិតសុទ្ធដែលត្រូវបានបំបែកចេញពីបរិស្ថានធម្មជាតិ (ឧទាហរណ៍ពីស្លឹកស្រូវដែលមានជំងឺនៅតាមវាលស្រែ) ហើយត្រូវបានយកមកបណ្តុះ និងរក្សាទុកក្នុងមន្ទីរពិសោធន៍ដើម្បីងាយស្រួលក្នុងការសិក្សាពីលក្ខណៈរបស់វា។ ដូចជាការចាប់ជនសង្ស័យម្នាក់ចេញពីហ្វូងមនុស្ស យកមកសួរចម្លើយ និងសិក្សាពីប្រវត្តិនៅក្នុងបន្ទប់ដាច់ដោយឡែក។
Phylogenetic tree (មែកធាងប្រវត្តិសាស្ត្រហ្សែន) ជាដ្យាក្រាមរាងដូចមែកធាងដែលបង្ហាញពីទំនាក់ទំនងនៃការវិវត្ត និងភាពស្រដៀងគ្នានៃសេនេទិចរវាងប្រភេទសត្វ រុក្ខជាតិ ឬមេរោគផ្សេងៗ ដោយផ្អែកលើការប្រៀបធៀបលំដាប់ហ្សែនរបស់ពួកវា។ ដូចជាការគូសគំនូសតាងពង្សាវតារគ្រួសារ ដើម្បីមើលថាតើនរណាជាបងប្អូនបង្កើត នរណាជាបងប្អូនជីដូនមួយ តាមរយៈខ្សែស្រឡាយឈាម។
Disease index (សន្ទស្សន៍ជំងឺ) ជារូបមន្តគណនាដែលបំប្លែងទិន្នន័យនៃការវាយតម្លៃកម្រិតភាពធ្ងន់ធ្ងរនៃរោគសញ្ញាជំងឺលើរុក្ខជាតិ (ពីកម្រិត ០ ដល់ ៥) ទៅជាភាគរយ (០% ទៅ ១០០%) ដើម្បីងាយស្រួលក្នុងការចាត់ថ្នាក់ និងប្រៀបធៀបកម្រិតភាពធន់របស់ពូជនិមួយៗប្រកបដោយស្តង់ដារ។ ដូចជាការបូកសរុបពិន្ទុមុខវិជ្ជាទាំងអស់របស់សិស្សម្នាក់ៗ រួចគិតជាភាគរយ ដើម្បីវាយតម្លៃថាអ្នកណាទទួលបាននិទ្ទេស A ឬ B។
UPGMA cluster analysis (ការវិភាគចង្កោមចំណាត់ថ្នាក់ទិន្នន័យ UPGMA) ជាវិធីសាស្ត្រស្ថិតិមួយប្រភេទដែលប្រើសម្រាប់វិភាគ និងចាត់ថ្នាក់ទិន្នន័យ (ក្នុងករណីនេះគឺកម្រិតភាពធន់របស់ពូជស្រូវទាំង ៧២) ទៅជាក្រុមតូចៗ (Clusters) ដោយផ្អែកលើភាពស្រដៀងគ្នានៃលទ្ធផល ដើម្បីបង្ហាញទិន្នន័យរួមក្នុងទម្រង់ងាយយល់។ ដូចជាការរៀបចំសៀវភៅរាប់ពាន់ក្បាលក្នុងបណ្ណាល័យ ដោយចាត់ថ្នាក់សៀវភៅដែលមានប្រធានបទស្រដៀងគ្នាដាក់ចូលក្នុងទូតែមួយ។
Bootstrap (ការធ្វើតេស្តបញ្ជាក់ភាពត្រឹមត្រូវនៃទិន្នន័យសេនេទិច) ជាវិធីសាស្ត្រស្ថិតិនៅក្នុងការវិភាគហ្សែន ដែលកម្មវិធីកុំព្យូទ័រធ្វើការទាញយកទិន្នន័យមកគណនាសាកល្បងឡើងវិញរាប់ពាន់ដង (ឧ. ១០០០ ដង) ដើម្បីវាស់ស្ទង់កម្រិតទំនុកចិត្ត (គិតជាភាគរយ) លើការចាត់ក្រុមក្នុងមែកធាងសេនេទិចថាតើវាត្រឹមត្រូវកម្រិតណា។ ដូចជាការសាកសួរសាក្សី ១០០០ នាក់អំពីហេតុការណ៍មួយ ប្រសិនបើ ៩៩០ នាក់ឆ្លើយដូចគ្នា នោះទំនុកចិត្តនៃសាច់រឿងគឺ ៩៩%។
Spore suspension (កំហាប់ស្ព័រផ្អាក / សូលុយស្យុងស្ព័រ) ជាការប្រមូលយកស្ព័រ (គ្រាប់ពូជបន្តពូជ) របស់មេរោគផ្សិត យកមកលាយជាមួយនឹងទឹកបរិសុទ្ធដើម្បីបង្កើតបានជាសូលុយស្យុងរាវដែលមានកំហាប់មេរោគជាក់លាក់មួយ (ឧ. 100,000 ស្ព័រក្នុង ១ មីលីលីត្រ) ដើម្បីត្រៀមយកទៅបាញ់សាកល្បងបង្កជំងឺលើរុក្ខជាតិ។ ដូចជាការលាយថ្នាំពុលទៅក្នុងទឹកក្នុងបរិមាណដ៏ជាក់លាក់មួយ មុននឹងយកវាទៅបាញ់សម្លាប់សត្វល្អិត ដើម្បីឱ្យដឹងច្បាស់ពីប្រសិទ្ធភាពរបស់វា។
Primers (ប្រាយមើរ) ជាបំណែកតូចៗនៃ DNA សិប្បនិម្មិតដែលត្រូវបានគេរចនាឡើងយ៉ាងជាក់លាក់ ដើម្បីទៅចាប់យក និងផ្តើមដំណើរការពង្រីកហ្សែនគោលដៅរបស់មេរោគ (ដូចជាហ្សែន ITS, 28S, ឫ GAPDH) នៅពេលធ្វើប្រតិកម្ម PCR ក្នុងម៉ាស៊ីន។ ដូចជាសោរឯកទេសមួយដែលជាងបានផលិតឡើងដើម្បីចាក់បើកទ្វារបន្ទប់ជាក់លាក់ណាមួយប៉ុណ្ណោះ វាមិនអាចចាក់បើកបន្ទប់ផ្សេងបានឡើយ។

៦. ប្រធានបទពាក់ព័ន្ធ (Further Reading)

អត្ថបទដែលបានបោះពុម្ពនៅលើ KhmerResearch ដែលទាក់ទងនឹងប្រធានបទនេះ៖

ប្រធានបទ និងសំណួរស្រាវជ្រាវដែលទាក់ទងនឹងឯកសារនេះ ដែលអ្នកអាចស្វែងរកបន្ថែម៖