Original Title: Characterization and Identification of a Streptomyces Strain with Biocontrol Activity against Aeromonas Hydrophila Causing Haemorrhage Disease in Fish
Source: doi.org/10.31817/vjas.2018.1.1.06
Disclaimer: Summary generated by AI based on the provided document. Please refer to the original paper for full scientific accuracy.

ការកំណត់លក្ខណៈ និងអត្តសញ្ញាណនៃប្រភេទបាក់តេរី Streptomyces ដែលមានសកម្មភាពទប់ស្កាត់ជីវសាស្ត្រប្រឆាំងនឹង Aeromonas Hydrophila ដែលបង្កជំងឺហូរឈាមលើត្រី

ចំណងជើងដើម៖ Characterization and Identification of a Streptomyces Strain with Biocontrol Activity against Aeromonas Hydrophila Causing Haemorrhage Disease in Fish

អ្នកនិពន្ធ៖ Nguyen Xuan Canh (Faculty of Biotechnology, Vietnam National University of Agriculture), Dinh Thi Thom (Faculty of Biotechnology, Vietnam National University of Agriculture), Nguyen Thanh Huyen (Faculty of Biotechnology, Vietnam National University of Agriculture)

ឆ្នាំបោះពុម្ព៖ 2018, Vietnam Journal of Agricultural Sciences

វិស័យសិក្សា៖ Biotechnology / Aquaculture Pathology

១. សេចក្តីសង្ខេបប្រតិបត្តិ (Executive Summary)

បញ្ហា (The Problem)៖ ឧស្សាហកម្មវារីវប្បកម្មនៅទូទាំងពិភពលោកកំពុងរងការគំរាមកំហែងយ៉ាងធ្ងន់ធ្ងរពីជំងឺហូរឈាមលើត្រីដែលបង្កឡើងដោយបាក់តេរី Aeromonas hydrophila ខណៈការប្រើប្រាស់ថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិចច្រើនពេកបានបណ្តាលឱ្យមានភាពស៊ាំនឹងថ្នាំ។

វិធីសាស្ត្រ (The Methodology)៖ ការសិក្សានេះបានធ្វើពិសោធន៍ដើម្បីចម្រាញ់ និងកំណត់អត្តសញ្ញាណបាក់តេរី Streptomyces ដែលមានសមត្ថភាពទប់ស្កាត់ជីវសាស្ត្រប្រឆាំងនឹងមេរោគបង្កជំងឺនេះ។

លទ្ធផលសំខាន់ៗ (The Verdict)៖

២. ការវិភាគលើប្រសិទ្ធភាព និងដែនកំណត់ (Performance & Constraints)

វិធីសាស្ត្រ (Method) គុណសម្បត្តិ (Pros) គុណវិបត្តិ (Cons) លទ្ធផលគន្លឹះ (Key Result)
Agar Diffusion Plate Method
វិធីសាស្ត្រសាយភាយលើចាហួយសម្រាប់ការសាកល្បងសកម្មភាពប្រឆាំងមេរោគ
ងាយស្រួលអនុវត្ត ចំណាយតិច និងអាចមើលឃើញលទ្ធផលនៃការទប់ស្កាត់បាក់តេរីបង្កជំងឺបានយ៉ាងច្បាស់លាស់។ មិនអាចបញ្ជាក់ពីយន្តការលម្អិតនៃសារធាតុប្រឆាំងបាក់តេរី ឬកំណត់អត្តសញ្ញាណប្រភេទសារធាតុគីមីដែលបានបញ្ចេញនោះទេ។ បានរកឃើញបាក់តេរី Streptomyces ចំនួន ៣ ប្រភេទ ក្នុងនោះប្រភេទ 1083 បង្កើតបានតំបន់គ្មានមេរោគ (Clear zone) ទំហំ ២៥ មីលីម៉ែត្រ។
16S rRNA Gene Sequencing
ការវិភាគលំដាប់សេនេទិច 16S rRNA និងការវិភាគម៉ូលេគុល
ផ្តល់លទ្ធផលច្បាស់លាស់ និងមានភាពជឿជាក់ខ្ពស់ក្នុងការកំណត់អត្តសញ្ញាណបាក់តេរីរហូតដល់កម្រិតប្រភេទ (Species level)។ ទាមទារឧបករណ៍វិភាគទំនើប អ្នកជំនាញបច្ចេកទេស និងចំណាយថវិកាច្រើនជាងវិធីសាស្ត្រជីវគីមីធម្មតា។ បានបញ្ជាក់យ៉ាងច្បាស់ថាបាក់តេរីប្រភេទ 1083 គឺពិតជា Streptomyces antibioticus ដែលមានភាពស្រដៀងគ្នានឹងទិន្នន័យយោងដល់ទៅ ៩៩%។
Morphological and Biochemical Characterization
ការកំណត់លក្ខណៈរូបសាស្ត្រ និងជីវគីមីសាស្ត្រ (Phenotypic Identification)
ជួយស្វែងយល់ពីលក្ខខណ្ឌល្អបំផុតសម្រាប់ការលូតលាស់ (សីតុណ្ហភាព កម្រិត pH កំហាប់អំបិល) និងប្រភពអាហារដែលបាក់តេរីត្រូវការ។ ប្រើប្រាស់ពេលវេលាយូរ (ឧទាហរណ៍ ត្រូវការពេល ២១ ថ្ងៃសម្រាប់តេស្តការបង្កើតមេឡានីន) និងពិបាកបែងចែកបាក់តេរីដែលមានលក្ខណៈស្រដៀងគ្នាខ្លាំង។ រកឃើញថាបាក់តេរី 1083 លូតលាស់ល្អនៅសីតុណ្ហភាព ៣០-៤៥ អង្សាសេ កម្រិត pH ៧-៩ និងអាចទ្រាំទ្រនឹងកំហាប់អំបិល <៥%។

ការចំណាយលើធនធាន (Resource Cost)៖ ការសិក្សានេះទាមទារមន្ទីរពិសោធន៍ជីវបច្ចេកវិទ្យាដែលមានឧបករណ៍សម្រាប់បណ្តុះមេរោគ និងម៉ាស៊ីនវិភាគសេនេទិចកម្រិតខ្ពស់។

៣. ការពិនិត្យសម្រាប់បរិបទកម្ពុជា/អាស៊ីអាគ្នេយ៍

ភាពលំអៀងនៃទិន្នន័យ (Data Bias)៖

ការសិក្សានេះត្រូវបានធ្វើឡើងដោយប្រើប្រាស់សំណាកដី និងបាក់តេរីបង្កជំងឺលើត្រីអណ្តែងដែលប្រមូលបានពីតំបន់ភាគខាងជើងនៃប្រទេសវៀតណាម។ ដោយសារប្រទេសកម្ពុជាមានលក្ខខណ្ឌអាកាសធាតុ កសិកម្ម និងប្រព័ន្ធវារីវប្បកម្មស្រដៀងគ្នានឹងវៀតណាម លទ្ធផលនេះមានសក្តានុពលខ្លាំង ប៉ុន្តែគួរមានការសិក្សាបន្ថែមលើសំណាកដី និងពូជត្រីក្នុងស្រុកដើម្បីធានាបាននូវប្រសិទ្ធភាពជាក់ស្តែង។

លទ្ធភាពនៃការអនុវត្ត (Applicability)៖

ការស្រាវជ្រាវនេះមានប្រយោជន៍យ៉ាងធំធេងសម្រាប់វិស័យវារីវប្បកម្មនៅកម្ពុជា ពិសេសក្នុងការស្វែងរកដំណោះស្រាយជំនួសការប្រើប្រាស់ថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិច។

ការផ្លាស់ប្តូរពីការពឹងផ្អែកលើថ្នាំគីមី មកប្រើប្រាស់ភ្នាក់ងារទប់ស្កាត់ជីវសាស្ត្រ (Biocontrol) នឹងជួយលើកកម្ពស់គុណភាពសុវត្ថិភាពត្រីនៅកម្ពុជា ព្រមទាំងចូលរួមកាត់បន្ថយបញ្ហាស៊ាំនឹងថ្នាំរបស់មេរោគ។

៤. ផែនការសកម្មភាពសម្រាប់និស្សិត (Actionable Roadmap)

ដើម្បីអនុវត្តតាមការសិក្សានេះ និស្សិតគួរអនុវត្តតាមជំហានខាងក្រោម៖

  1. សិក្សាពីបច្ចេកទេសបណ្តុះ និងចម្រាញ់បាក់តេរី: និស្សិតត្រូវអនុវត្តការរៀបចំមជ្ឈដ្ឋានចិញ្ចឹម (Culture Media) ដូចជា Gause-1 និង ISP media ដើម្បីបណ្តុះ និងបែងចែកបាក់តេរី Streptomyces ពីសំណាកដីក្នុងស្រុក។
  2. អនុវត្តការធ្វើតេស្តសកម្មភាពប្រឆាំងមេរោគ: ប្រើប្រាស់វិធីសាស្ត្រ Agar Diffusion Plate Method នៅក្នុងបន្ទប់ពិសោធន៍ ដើម្បីសាកល្បងប្រសិទ្ធភាពនៃសំណាកបាក់តេរីដែលបានចម្រាញ់ ប្រឆាំងនឹងមេរោគបង្កជំងឺលើត្រី Aeromonas hydrophila
  3. រៀនប្រើប្រាស់ឧបករណ៍វិភាគម៉ូលេគុល: អនុវត្តបច្ចេកទេសចម្រាញ់ DNA និងប្រើប្រាស់ម៉ាស៊ីន Thermal Cycler ដោយប្រើប្រាស់ Primers (27F, 1492R) ដើម្បីពង្រីកសេនេទិច 16S rRNA សម្រាប់ការកំណត់អត្តសញ្ញាណបាក់តេរី។
  4. វិភាគទិន្នន័យសេនេទិចដោយប្រើប្រាស់ប្រព័ន្ធកុំព្យូទ័រ (Bioinformatics): ហ្វឹកហាត់ប្រើប្រាស់ឧបករណ៍ NCBI BLAST និងកម្មវិធី MEGA6 ដើម្បីប្រៀបធៀបទិន្នន័យ DNA និងសាងសង់មែកធាងវិវត្តន៍ (Phylogenetic tree) ដើម្បីបញ្ជាក់ប្រភេទបាក់តេរីអោយបានច្បាស់លាស់។

៥. វាក្យសព្ទបច្ចេកទេស (Technical Glossary)

ពាក្យបច្ចេកទេស ការពន្យល់ជាខេមរភាសា (Khmer Explanation) និយមន័យសាមញ្ញ (Simple Definition)
Biocontrol Activity (សកម្មភាពទប់ស្កាត់ជីវសាស្ត្រ) ការប្រើប្រាស់អតិសុខុមប្រាណ ឬសារពាង្គកាយមានជីវិតមួយ (ដូចជា Streptomyces) ដើម្បីកម្ចាត់ ឬទប់ស្កាត់ការលូតលាស់របស់មេរោគបង្កជំងឺ ឬសត្វល្អិតចង្រៃ ជាជាងការប្រើប្រាស់សារធាតុគីមី ឬថ្នាំអង់ទីប៊ីយោទិចសិប្បនិម្មិត។ ដូចជាការចិញ្ចឹមឆ្មាដើម្បីចាប់កណ្តុរក្នុងផ្ទះ ជាជាងការប្រើថ្នាំបំពុលកណ្តុរដែលប៉ះពាល់ដល់បរិស្ថាន។
Agar diffusion plate method (វិធីសាស្ត្រសាយភាយលើចាហួយ) វិធីសាស្ត្រមន្ទីរពិសោធន៍ដែលគេដាក់សារធាតុ ឬបាក់តេរីម្យ៉ាងនៅលើផ្ទៃចាហួយចិញ្ចឹមមេរោគ ដើម្បីសង្កេតមើលថាតើសារធាតុនោះអាចសាយភាយ និងសម្លាប់មេរោគដែលនៅជុំវិញវាបានកម្រិតណា ដោយវាស់អង្កត់ផ្ចិតនៃតំបន់គ្មានមេរោគ (Clear zone)។ ដូចជាការទម្លាក់ដុំសាប៊ូចូលក្នុងទឹកដែលមានខ្លាញ់ ហើយសង្កេតមើលខ្លាញ់រត់ចេញឆ្ងាយបង្កើតជារង្វង់ទឹកថ្លា។
16S rRNA Sequence analysis (ការវិភាគលំដាប់សេនេទិច 16S rRNA) បច្ចេកទេសវិភាគ DNA កូដសេនេទិច (ហ្សែន 16S rRNA) ដែលមាននៅក្នុងរ៉៊ីបូសូម (Ribosome) របស់បាក់តេរី ដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណថាវាជាបាក់តេរីប្រភេទអ្វីឱ្យបានច្បាស់លាស់ ដោយប្រៀបធៀបលំដាប់នោះជាមួយប្រព័ន្ធទិន្នន័យយោងជាសកល (GenBank)។ ដូចជាការស្កែនក្រាមពិន្ទុម្រាមដៃ (Fingerprint) របស់មនុស្សម្នាក់ ដើម្បីផ្ទៀងផ្ទាត់អត្តសញ្ញាណនៅក្នុងប្រព័ន្ធកុំព្យូទ័រទូទាំងពិភពលោក។
Phylogenetic tree (មែកធាងវិវត្តន៍សេនេទិច) ដ្យាក្រាមដែលមានរូបរាងដូចមែកឈើ ដែលបង្ហាញពីទំនាក់ទំនងនៃការវិវត្ត និងភាពជិតស្និទ្ធខាងសេនេទិចរវាងប្រភេទអតិសុខុមប្រាណផ្សេងៗគ្នា ផ្អែកលើភាពស្រដៀងគ្នានៃ DNA របស់ពួកវា។ ដូចជាគំនូសតារាងខ្សែស្រឡាយវង្សត្រកូល (Family Tree) ដែលបង្ហាញថាអ្នកណាជាបងប្អូនជីដូនមួយនឹងអ្នកណាក្នុងគ្រួសារ។
Scanning electron microscope / SEM (ម៉ាស៊ីនមីក្រូទស្សន៍អេឡិចត្រុងប្រភេទស្កែន) ឧបករណ៍មើលវត្ថុលម្អិតកម្រិតខ្ពស់ដែលប្រើប្រាស់កាំរស្មីអេឡិចត្រុង ដើម្បីបង្កើតរូបភាព 3D នៃផ្ទៃខាងក្រៅរបស់វត្ថុ ឬមីក្រូសរីរាង្គតូចៗបំផុត (ដូចជាស្ពែររបស់បាក់តេរី) ដោយអាចពង្រីកបានរាប់ម៉ឺនដង (ឧ. 6000X ដល់ 25000X)។ ដូចជាកាមេរ៉ាស៊ីបកម្រិតកំពូល ដែលមិនត្រឹមតែអាចថតឃើញផ្ទៃមុខមនុស្សពីចម្ងាយ តែអាចពង្រីកមើលឃើញច្បាស់ដល់រន្ធញើសនីមួយៗ។
Spore chain (ខ្សែសង្វាក់ស្ពែរ) ទម្រង់បន្តពូជរបស់បាក់តេរី Streptomyces ដែលបង្កើតជាកោសិកាស្ពែរ (Spores) តូចៗតម្រៀបគ្នាជាជួរៗនៅពេលដែលពួកវាលូតលាស់ដល់ដំណាក់កាលពេញវ័យ។ ស្ពែរទាំងនេះនឹងរបូតចេញដើម្បីបង្កើតកោសិកាថ្មីនៅពេលលក្ខខណ្ឌអំណោយផល។ ដូចជាគ្រាប់អង្កាំដែលដោតតម្រៀបគ្នាជាខ្សែ ហើយនៅពេលទុំ គ្រាប់អង្កាំទាំងនោះនឹងជ្រុះរាយប៉ាយដើម្បីដុះជាដើមថ្មី។
Aerial mycelium (មីសេល្យូមលើផ្ទៃ) បណ្តាញសរសៃនៃការលូតលាស់របស់បាក់តេរី Streptomyces ដែលលូតលាស់ផុសឡើងលើអាកាស (ផុតពីផ្ទៃចំណី) ដើម្បីបង្កើតស្ពែរបន្តពូជ (Spore formation) និងជួយឱ្យស្ពែរងាយសាយភាយទៅកន្លែងផ្សេង។ ប្រៀបដូចជាមែកឈើដែលលូតឡើងលើអាកាសដើម្បីបញ្ចេញផ្កា និងផ្លែ ងាយស្រួលឱ្យខ្យល់បក់យកគ្រាប់ពូជទៅឆ្ងាយ។
Melanin pigmentation (ការផលិតជាតិពណ៌មេឡានីន) សមត្ថភាពរបស់បាក់តេរីក្នុងការបញ្ចេញសារធាតុពណ៌ត្នោត ឬខ្មៅ (មេឡានីន) ទៅក្នុងមជ្ឈដ្ឋានចិញ្ចឹម (Culture medium) ដែលបាតុភូតនេះត្រូវបានគេប្រើប្រាស់ជាលក្ខណៈវិនិច្ឆ័យមួយក្នុងការចំណាត់ថ្នាក់អំបូរ Streptomyces ដូចជាសត្វមឹកដែលព្រួសទឹកខ្មៅទៅក្នុងទឹកសមុទ្រ ធ្វើឱ្យទឹកដែលនៅជុំវិញខ្លួនវាប្រែជាពណ៌ខ្មៅ។

៦. ប្រធានបទពាក់ព័ន្ធ (Further Reading)

អត្ថបទដែលបានបោះពុម្ពនៅលើ KhmerResearch ដែលទាក់ទងនឹងប្រធានបទនេះ៖

ប្រធានបទ និងសំណួរស្រាវជ្រាវដែលទាក់ទងនឹងឯកសារនេះ ដែលអ្នកអាចស្វែងរកបន្ថែម៖