Original Title: Chapter - 22 Gene Editing
Source: doi.org/10.22271/ed.book.2031
Document Type: Textbook / Educational Material
Disclaimer: Summary generated by AI based on the provided document. Please refer to the original material for complete content.

ជំពូកទី ២២ - ការកែសម្រួលហ្សែន

ចំណងជើងដើម៖ Chapter - 22 Gene Editing

អ្នកនិពន្ធ៖ Vikas Singh (SVPUA & T, Meerut, Uttar Pradesh, India), Vishwajeet Yadav (SVPUA & T, Meerut, Uttar Pradesh, India), Ravi Kumar (SVPUA & T, Meerut, Uttar Pradesh, India), Ankit Kumar Sharma (SVPUA & T, Meerut, Uttar Pradesh, India), Vyankatesh Dhanraj Bagul (SVPUA & T, Meerut, Uttar Pradesh, India)

ឆ្នាំបោះពុម្ព៖ 2022, AkiNik Publications

វិស័យសិក្សា៖ Agricultural Biotechnology

១. សេចក្តីសង្ខេប (Overview)

ប្រធានបទ (Topic)៖ ឯកសារនេះដោះស្រាយអំពីតម្រូវការនៃបច្ចេកវិទ្យាកែប្រែហ្សែន (Gene editing) ដែលមានភាពជាក់លាក់ខ្ពស់ ដើម្បីដោះស្រាយបញ្ហាប្រឈមក្នុងផលិតភាពកសិកម្ម ភាពធន់នឹងជំងឺ និងការព្យាបាលជំងឺតំណពូជ។

រចនាសម្ព័ន្ធ (Structure)៖ ជំពូកនេះធ្វើការពិនិត្យឡើងវិញយ៉ាងប្រៀបធៀប អំពីយន្តការ និងប្រសិទ្ធភាពនៃឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែន (Gene editing tools) សំខាន់ៗចំនួនបួនប្រភេទ។

ចំណុចសំខាន់ៗ (Key Takeaways)៖

២. គោលបំណងសិក្សា (Learning Objectives)

បន្ទាប់ពីអានឯកសារនេះ អ្នកគួរអាច៖

  1. យល់ដឹងពីគោលគំនិត និងនិយមន័យនៃបច្ចេកវិទ្យាកែសម្រួលហ្សែន (Gene Editing) នៅក្នុងប្រព័ន្ធជីវសាស្ត្រ
  2. ប្រៀបធៀបយន្តការ គុណសម្បត្តិ និងគុណវិបត្តិនៃឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែនផ្សេងៗគ្នាដូចជា ZFNs, TALENs និងប្រព័ន្ធ CRISPR/Cas9
  3. សិក្សាពីការអនុវត្តបច្ចេកវិទ្យាកែសម្រួលហ្សែនក្នុងការស្រាវជ្រាវមូលដ្ឋាន វេជ្ជសាស្ត្រ (Animal therapeutic) និងការកែលម្អពូជដំណាំកសិកម្ម (Agricultural Biotechnology)
  4. ស្វែងយល់ពីបច្ចេកទេសថ្មីៗដូចជា PASTE សម្រាប់ការបញ្ចូលកូដ DNA ខ្នាតធំដោយសុវត្ថិភាពដោយមិនប្រើវិធីកាត់ផ្តាច់ខ្សែ DNA ទ្វេ (DSBs)

ជំពូកនេះផ្តោតលើការបង្ហាញពីការវិវឌ្ឍនៃឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែន (Gene editing tools) ដូចជា ការប្រើប្រាស់អង់ស៊ីម Restriction, ZFNs, TALENs, និងជាពិសេសគឺប្រព័ន្ធ CRISPR/Cas9 និងបច្ចេកទេស PASTE។ វាក៏បានលើកឡើងយ៉ាងលម្អិតអំពីយន្តការប្រតិបត្តិការ គុណសម្បត្តិ និងការប្រើប្រាស់បច្ចេកវិទ្យាទាំងនេះនៅក្នុងវិស័យកសិកម្ម ការអភិវឌ្ឍថ្នាំពេទ្យ និងការព្យាបាលជំងឺកោសិកា ជំងឺហ្សែន និងជំងឺមហារីកផ្សេងៗ។

៣. គោលគំនិតសំខាន់ៗ (Key Concepts)

គោលគំនិត (Concept) ការពន្យល់ (Explanation) ឧទាហរណ៍ (Example)
CRISPR/Cas9 System
ប្រព័ន្ធបន្សាំភាពស៊ាំរបស់បាក់តេរី (CRISPR/Cas9)
វាជាឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែនដ៏មានប្រសិទ្ធភាពដែលប្រើប្រាស់ RNA ជាមគ្គុទ្ទេសក៍ (guide RNA) ដើម្បីដឹកនាំអង់ស៊ីម Cas9 ទៅកាន់ទីតាំងគោលដៅនៃ DNA រួចធ្វើការកាត់ផ្តាច់ (Cleavage)។ វាមានលក្ខណៈងាយស្រួល លឿន ចំណាយតិច និងមានភាពជាក់លាក់ខ្ពស់ក្នុងការកែប្រែហ្សែន ដែលមានប្រភពដើមពីប្រព័ន្ធការពារខ្លួនរបស់បាក់តេរីប្រឆាំងនឹងវីរុស។ ការប្រើប្រាស់ CRISPR/Cas9 ដើម្បីទប់ស្កាត់ការកើនឡើងនៃកោសិកាមហារីកថ្លើម (Hepatocellular carcinoma - HCC) តាមរយៈការកាត់បន្ថយការបញ្ចេញប្រូតេអ៊ីន SIRT6 ឬការបង្កើតពូជដំណាំដែលធន់នឹងជំងឺ។
Zinc Finger Nucleases (ZFNs)
នុយក្លេអេសម្រាមដៃស័ង្កសី (ZFNs)
ជាប្រូតេអ៊ីនកែច្នៃ (Engineered proteins) ដែលអាចស្គាល់លំដាប់ DNA ជាក់លាក់ និងភ្ជាប់មកជាមួយនូវអង់ស៊ីមកាត់ DNA (Fok I Nuclease)។ បច្ចេកទេសនេះអនុញ្ញាតឱ្យមានការកាត់គោលដៅ និងតម្រូវឱ្យមានការរចនាប្រូតេអ៊ីនយ៉ាងស្មុគស្មាញ។ ការប្រើប្រាស់ ZFNs ដើម្បីកែប្រែហ្សែនស្រូវសាលី (Wheat) ឱ្យមានភាពធន់នឹងថ្នាំសម្លាប់ស្មៅ Imazamox តាមរយៈការផ្លាស់ប្តូរអាស៊ីតអាមីណូតែមួយនៅក្នុងហ្សែន AHAS។
Transcription activator-like effector nucleases (TALENs)
នុយក្លេអេសប្រភេទ TALENs
ជាឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែនដែលប្រើប្រូតេអ៊ីន TALE ដើម្បីស្គាល់លំដាប់ DNA បញ្ចូលគ្នាជាមួយអង់ស៊ីមកាត់ (Nuclease) ដើម្បីបង្កើតការកាត់ផ្តាច់ខ្សែ DNA ទ្វេ (Double-strand breaks - DSBs)។ វាផ្តល់នូវភាពជាក់លាក់ខ្ពស់ជាង ZFNs ក្នុងការផ្លាស់ប្តូរ លុប ឬបញ្ចូលហ្សែន។ ការប្រើប្រាស់ TALENs ដើម្បីបង្កើតថ្នាំសម្រាប់ការព្យាបាលជំងឺដែលបណ្តាលមកពីភាពមិនប្រក្រតីនៃហ្សែន (Genetic disorders) តាមរយៈដំណើរការរៀបចំខ្សែ DNA ឡើងវិញ (Recombination)។
PASTE Technique (Drag-and-Drop large insertion editing)
បច្ចេកទេស PASTE (ការបញ្ចូលកូដតាមគោលដៅខ្នាតធំ)
ជាបច្ចេកទេសកែសម្រួលហ្សែនជំនាន់ថ្មីដែលអនុញ្ញាតឱ្យមានការបញ្ចូលបំណែក DNA ខ្នាតធំ (រហូតដល់ 36 kb) ចូលទៅក្នុងហ្សែនដោយមិនចាំបាច់បង្កឱ្យមានការកាត់ផ្តាច់ខ្សែ DNA ទ្វេ (DSBs) ឡើយ។ វាប្រើប្រាស់ប្រូតេអ៊ីន integrase ពីបាក់តេរីដើម្បីទាញយកសម្ភារៈហ្សែនបញ្ចូលទៅទីតាំងគោលដៅ។ វាមានសក្តានុពលខ្លាំងក្នុងការព្យាបាលជំងឺតំណពូជដែលបណ្តាលមកពីការបម្រែបម្រួលហ្សែនខ្នាតធំ (Mutations in big genes) ដោយធានាបាននូវសុវត្ថិភាពខ្ពស់ក្នុងការកែប្រែហ្សែន។

៤. ភាពពាក់ព័ន្ធសម្រាប់កម្ពុជា (Cambodia Relevance)

បច្ចេកវិទ្យាកែសម្រួលហ្សែន (Gene Editing) មានសារៈសំខាន់ខ្លាំងសម្រាប់ប្រទេសកម្ពុជាក្នុងការធ្វើទំនើបកម្មវិស័យកសិកម្ម ធានាសន្តិសុខស្បៀង និងការអភិវឌ្ឍវិស័យសុខាភិបាលសាធារណៈ។

ការអនុវត្ត (Applications)៖

ការបញ្ចូលចំណេះដឹងផ្នែក Gene Editing ទៅក្នុងកម្មវិធីសិក្សាជីវបច្ចេកវិទ្យានៅសាកលវិទ្យាល័យក្នុងប្រទេសកម្ពុជា នឹងជួយបណ្តុះបណ្តាលនិស្សិតឱ្យមានសមត្ថភាពខ្ពស់ក្នុងការស្រាវជ្រាវ និងបង្កើតនវានុវត្តន៍ថ្មីៗឆ្លើយតបទៅនឹងបញ្ហាប្រឈមជាតិ និងពិភពលោក។

៥. មគ្គុទ្ទេសក៍សិក្សា (Study Guide)

លំហាត់ និងសកម្មភាពសិក្សាដើម្បីពង្រឹងការយល់ដឹង៖

  1. ការគូរគំនូសបំព្រួញប្រព័ន្ធ CRISPR (Diagramming CRISPR Mechanism): សិស្សត្រូវគូរ និងពន្យល់លម្អិតពីយន្តការនៃប្រព័ន្ធ CRISPR/Cas9 ដោយចាប់ផ្តើមពីដំណាក់កាល Adaptation (Acquisition), Expression (Biogenesis), រហូតដល់ Interference ព្រមទាំងរំលេចតួនាទីរបស់ gRNA, PAM sequence និងអង់ស៊ីម Cas9។
  2. ការស្រាវជ្រាវករណីសិក្សាលើដំណាំ (Case Study Research on Crops): ចែកក្រុមនិស្សិតឱ្យស្រាវជ្រាវអត្ថបទវិទ្យាសាស្ត្រ (Research Papers) តាមរយៈ Google Scholar អំពីការប្រើប្រាស់ CRISPR លើដំណាំស្រូវ (Rice) ឬពោត (Maize) ដើម្បីបង្កើនទិន្នផល ឬភាពធន់ រួចធ្វើបទបង្ហាញជាក្រុមដល់សិស្សក្នុងថ្នាក់។
  3. ការវិភាគប្រៀបធៀបឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែន (Comparative Analysis Table): សិស្សត្រូវបង្កើតតារាងប្រៀបធៀបរវាង ZFNs, TALENs, និង CRISPR/Cas9 ដោយផ្អែកលើចំណុចសំខាន់ៗដូចជា ប្រភពដើម (Source), ភាពជាក់លាក់ (Targeting specificity), កម្រិតភាពងាយស្រួលនៃការប្រើប្រាស់ (Ease of engineering), និងតម្លៃ (Cost) ដោយផ្អែកលើតារាងទី១ ក្នុងសៀវភៅ។
  4. ការពិភាក្សាពីក្រមសីលធម៌នៃការកែប្រែហ្សែន (Ethics in Gene Editing Debate): រៀបចំវេទិកាពិភាក្សា (Debate) នៅក្នុងថ្នាក់រៀនអំពីផលប៉ះពាល់ផ្នែកសីលធម៌ និងសុវត្ថិភាពនៃការប្រើប្រាស់បច្ចេកវិទ្យាកែសម្រួលហ្សែន (Genetic Disease Treatment & Crop Modification) ទៅលើសង្គមមនុស្ស និងបរិស្ថានវិទ្យា ជាពិសេសសម្រាប់ប្រទេសកម្ពុជា។

៦. វាក្យសព្ទបច្ចេកទេស (Technical Glossary)

ពាក្យបច្ចេកទេស (English) ការពន្យល់ជាខេមរភាសា (Khmer Explanation) និយមន័យសាមញ្ញ (Simple Definition)
CRISPR/Cas9 ជាប្រព័ន្ធកែសម្រួលហ្សែនដ៏ទំនើប ដែលយកចេញពីប្រព័ន្ធការពារខ្លួនរបស់បាក់តេរីប្រឆាំងនឹងវីរុស។ វាប្រើប្រាស់ RNA ជាអ្នកដឹកនាំ (guide RNA) ដើម្បីនាំអង់ស៊ីម Cas9 ទៅកាត់ផ្តាច់ខ្សែ DNA នៅទីតាំងជាក់លាក់ណាមួយ ដើម្បីកែប្រែ ឬលុបបំបាត់ហ្សែនដែលមានបញ្ហាដោយភាពច្បាស់លាស់ លឿន និងចំណាយតិច។ ដូចជាកន្ត្រៃឆ្លាតវៃដែលអាចរកឃើញកន្លែងខូចខាតនៅលើខ្សែអាត់វីដេអូ ហើយកាត់វាចេញដើម្បីតភ្ជាប់ថ្មីបានយ៉ាងត្រឹមត្រូវ។
Zinc finger nucleases (ZFNs) ជាឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែនជំនាន់ដំបូង ដែលផ្សំឡើងដោយប្រូតេអ៊ីនស្គាល់ DNA (Zinc finger) និងអង់ស៊ីមកាត់ DNA (Fok I)។ ទោះបីជាវាអាចកាត់ DNA តាមគោលដៅបានមែន ប៉ុន្តែវាមានតម្លៃថ្លៃ លំបាកក្នុងការរចនា និងមានប្រសិទ្ធភាពមធ្យមបើធៀបនឹងបច្ចេកវិទ្យាថ្មីៗ។ ដូចជាកូនសោរដែលគេត្រូវចំណាយពេលពត់ច្នៃយ៉ាងលំបាក ដើម្បីឱ្យត្រូវនឹងមេសោរតែមួយគត់មុននឹងអាចកាត់ផ្តាច់វាបាន។
Transcription activator-like effector nucleases (TALENs) ជាប្រព័ន្ធកែសម្រួលហ្សែនស្រដៀងនឹង ZFNs ដែរ ប៉ុន្តែវាប្រើប្រាស់ប្រូតេអ៊ីនប្រភេទ TALE ដើម្បីស្វែងរកទីតាំង DNA ចំគោលដៅ។ វាត្រូវបានប្រើប្រាស់យ៉ាងទូលំទូលាយក្នុងការបង្កើតថ្នាំព្យាបាលជំងឺហ្សែនផ្សេងៗតាមរយៈការកាត់ផ្តាច់ខ្សែ DNA ទ្វេ (DSBs) ទោះបីជាការផលិតរបស់វានៅមានភាពស្មុគស្មាញក៏ដោយ។ ដូចជាឧបករណ៍កាត់វត្ថុមួយ ដែលត្រូវតម្រូវឱ្យអ្នកវាយបញ្ចូលកូដសម្ងាត់យ៉ាងវែងនិងជាក់លាក់ ទើបវាដំណើរការកាត់ចំគោលដៅបាន។
Double-strand breaks (DSBs) ជាការកាត់ផ្តាច់ខ្សែទាំងពីរនៃម៉ូលេគុល DNA ក្នុងពេលតែមួយ ដែលជាយន្តការចម្បងនៃឧបករណ៍កែសម្រួលហ្សែនភាគច្រើន (ដូចជា CRISPR, ZFNs, TALENs)។ ក្រោយពេលកាត់ផ្តាច់ កោសិកានឹងធ្វើការជួសជុលដោយខ្លួនឯង ដែលអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកវិទ្យាសាស្ត្របញ្ចូល ឬកែប្រែហ្សែននៅទីតាំងនោះ។ ដូចជាការកាត់ផ្តាច់ស្ពានយោលទាំងស្រុង ដើម្បីសាងសង់តភ្ជាប់កំណាត់ស្ពានថ្មីមួយទៀតចូលទៅជំនួសវិញ។
PASTE មកពីពាក្យពេញ Programmable Addition through Site-specific Targeting Elements គឺជាបច្ចេកទេសកែសម្រួលហ្សែនជំនាន់ថ្មី ដែលអនុញ្ញាតឱ្យមានការបញ្ចូលបំណែក DNA ខ្នាតធំ (រហូតដល់ 36 kb) ទៅក្នុងហ្សែន ដោយមិនចាំបាច់កាត់ផ្តាច់ខ្សែ DNA ទ្វេ (DSBs) ឡើយ ដែលធ្វើឱ្យវាមានសុវត្ថិភាពខ្ពស់។ ដូចជាការចម្លងនិងទម្លាក់ (Copy & Paste) អត្ថបទមួយកថាខណ្ឌទាំងមូលចូលទៅក្នុងឯកសារ ដោយមិនធ្វើឱ្យខូចទ្រង់ទ្រាយអត្ថបទដើម។
Guide RNA (gRNA) ជាម៉ូលេគុល RNA ខ្លីៗដែលត្រូវបានរចនាឡើងដោយអ្នកវិទ្យាសាស្ត្រ ដើម្បីចាប់គូជាមួយលំដាប់ DNA គោលដៅនៅក្នុងប្រព័ន្ធ CRISPR/Cas9។ តួនាទីរបស់វាគឺដឹកនាំអង់ស៊ីម Cas9 ទៅកាន់ទីតាំងច្បាស់លាស់នៃហ្សែនដែលត្រូវកាត់។ ដូចជាកម្មវិធីផែនទី GPS ដែលចង្អុលបង្ហាញផ្លូវយ៉ាងច្បាស់លាស់ ឱ្យអ្នកបើកបរ (អង់ស៊ីម Cas9) ទៅដល់ទីតាំងដែលត្រូវធ្វើការងារ។
Non-homologous end joining (NHEJ) ជាយន្តការជួសជុល DNA តាមបែបធម្មជាតិរបស់កោសិកា បន្ទាប់ពីមានការកាត់ផ្តាច់ខ្សែ DNA ទ្វេ (DSBs)។ យន្តការនេះតភ្ជាប់ចុងសងខាងនៃ DNA ចូលគ្នាវិញដោយមិនត្រូវការខ្សែគំរូ (Template) ឡើយ ដែលជារឿយៗបង្កឱ្យមានការបាត់បង់ ឬបន្ថែមបំណែក DNA បន្តិចបន្តួចនៅកន្លែងតភ្ជាប់។ ដូចជាការយកកាវមកបិទតភ្ជាប់បំណែកកែវដែលបែកចូលគ្នាវិញភ្លាមៗ ទោះបីជារាងរបស់វាមិនស្អាតដូចដើម ១០០ ភាគរយក៏ដោយ។

៧. ប្រធានបទពាក់ព័ន្ធ (Further Reading)

អត្ថបទដែលបានបោះពុម្ពនៅលើ KhmerResearch ដែលទាក់ទងនឹងប្រធានបទនេះ៖

ប្រធានបទ និងសំណួរស្រាវជ្រាវដែលទាក់ទងនឹងឯកសារនេះ ដែលអ្នកអាចស្វែងរកបន្ថែម៖