Original Title: Nitrogen-use Efficiency Evaluation and Genome Survey of Vietnamese Rice Landraces (Oryza sativa L.)
Source: doi.org/10.31817/vjas.2018.1.2.04
Disclaimer: Summary generated by AI based on the provided document. Please refer to the original paper for full scientific accuracy.

ការវាយតម្លៃប្រសិទ្ធភាពនៃការប្រើប្រាស់អាសូត និងការស្ទង់មតិហ្សែននៃពូជស្រូវក្នុងស្រុករបស់វៀតណាម (Oryza sativa L.)

ចំណងជើងដើម៖ Nitrogen-use Efficiency Evaluation and Genome Survey of Vietnamese Rice Landraces (Oryza sativa L.)

អ្នកនិពន្ធ៖ Nguyen Thi Thuy Hanh (Vietnam National University of Agriculture), Dinh Mai Thuy Linh (Center of International Plant Research Vietnam and Japan), Nguyen Quoc Trung (Vietnam National University of Agriculture), Pham Van Cuong (Vietnam National University of Agriculture)

ឆ្នាំបោះពុម្ព៖ 2018, Vietnam Journal of Agricultural Sciences

វិស័យសិក្សា៖ Agricultural Biotechnology

១. សេចក្តីសង្ខេបប្រតិបត្តិ (Executive Summary)

បញ្ហា (The Problem)៖ ការប្រើប្រាស់ជីលើសកម្រិតបណ្តាលឱ្យខាតបង់ធនធាន និងប៉ះពាល់ដល់បរិស្ថាន ដូច្នេះការស្វែងរកពូជស្រូវដែលមានប្រសិទ្ធភាពប្រើប្រាស់អាសូត (NUE) ខ្ពស់គឺជារឿងចាំបាច់សម្រាប់កសិកម្មប្រកបដោយចីរភាព។ ការសិក្សានេះវាយតម្លៃកម្រិត NUE នៃពូជស្រូវចំនួន ៦ ប្រភេទ ដើម្បីកំណត់អត្តសញ្ញាណពូជសក្ដានុពលសម្រាប់ការវិភាគហ្សែនបន្ត។

វិធីសាស្ត្រ (The Methodology)៖ ការស្រាវជ្រាវនេះត្រូវបានអនុវត្តតាមរយៈការដាំដុះក្នុងផើងពិសោធន៍ជាមួយនឹងកម្រិតជីអាសូតផ្សេងៗគ្នា រួមផ្សំជាមួយការវិភាគម៉ាកឃ័រម៉ូលេគុលដើម្បីបង្កើតផែនទីរូបវន្តនៃក្រូម៉ូសូម។

លទ្ធផលសំខាន់ៗ (The Verdict)៖

២. ការវិភាគលើប្រសិទ្ធភាព និងដែនកំណត់ (Performance & Constraints)

វិធីសាស្ត្រ (Method) គុណសម្បត្តិ (Pros) គុណវិបត្តិ (Cons) លទ្ធផលគន្លឹះ (Key Result)
Phenotypic Screening for Nitrogen Use Efficiency (NUE)
ការវាយតម្លៃប្រសិទ្ធភាពប្រើប្រាស់អាសូត (NUE) តាមរយៈការដាំដុះក្នុងផើង
ឆ្លុះបញ្ចាំងយ៉ាងច្បាស់ពីការលូតលាស់ជាក់ស្តែងរបស់រុក្ខជាតិ និងងាយស្រួលក្នុងការប្រៀបធៀបទិន្នផលជីវម៉ាសក្រោមលក្ខខណ្ឌជីផ្សេងៗគ្នា។ ទាមទារពេលវេលាយូរ (រហូតដល់ពេលប្រមូលផល) ការរៀបចំស្មុគស្មាញ និងរងឥទ្ធិពលខ្លាំងពីមជ្ឈដ្ឋានខាងក្រៅ។ ពូជស្រូវ Chiem Tay (CT) បង្ហាញប្រសិទ្ធភាពប្រើប្រាស់អាសូត (NUE) ខ្ពស់បំផុត ខណៈពូជ P6DB មានកម្រិតទាបបំផុតនៅគ្រប់ដំណាក់កាលលូតលាស់។
Whole Genome Survey using SSR and STS Markers
ការស្ទង់មតិហ្សែនដោយប្រើម៉ាកឃ័រម៉ូលេគុល SSR និង STS
ផ្តល់ព័ត៌មានហ្សែនច្បាស់លាស់ដល់កម្រិតម៉ូលេគុល ដែលជាមូលដ្ឋានគ្រឹះដ៏សំខាន់សម្រាប់ការកំណត់ទីតាំងហ្សែន (QTLs) និងការបង្កាត់ពូជ (MAS) នាពេលអនាគត។ ទាមទារឧបករណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ទំនើប អ្នកជំនាញបច្ចេកទេសកម្រិតខ្ពស់ និងចំណាយថវិកាច្រើនទៅលើសារធាតុគីមី និងម៉ាកឃ័រ។ រកឃើញម៉ាកឃ័រពហុរូបិយ (Polymorphic markers) ចំនួន ៩៧ សម្រាប់ការសាងសង់ផែនទីរូបវន្តលើក្រូម៉ូសូមស្រូវទាំង១២។

ការចំណាយលើធនធាន (Resource Cost)៖ ការសិក្សានេះទាមទារធនធានមន្ទីរពិសោធន៍កសិកម្ម និងជីវបច្ចេកវិទ្យាកម្រិតខ្ពស់ រួមទាំងឧបករណ៍វិភាគ DNA និងផ្ទះសំណាញ់សម្រាប់ការដាំដុះពិសោធន៍។

៣. ការពិនិត្យសម្រាប់បរិបទកម្ពុជា/អាស៊ីអាគ្នេយ៍

ភាពលំអៀងនៃទិន្នន័យ (Data Bias)៖

ការសិក្សានេះត្រូវបានអនុវត្តផ្តាច់មុខទៅលើពូជស្រូវក្នុងស្រុកចំនួន ៦ ប្រភេទមកពីភាគខាងជើងនៃប្រទេសវៀតណាម (ឧទាហរណ៍ ពូជ Chiem Tay និង P6DB) ក្រោមលក្ខខណ្ឌអាកាសធាតុ និងដីនៅទីក្រុងហាណូយ។ សម្រាប់ប្រទេសកម្ពុជា ទោះបីជាស្ថិតក្នុងតំបន់អាស៊ីអាគ្នេយ៍ដូចគ្នាក៏ដោយ ក៏ពូជស្រូវក្នុងស្រុករបស់កម្ពុជា (ដូចជា ផ្ការំដួល ឬ នាងមាស) មានលក្ខណៈសេនេទិចដាច់ដោយឡែក និងលក្ខខណ្ឌដីខុសគ្នា ដែលទាមទារឱ្យមានការធ្វើតេស្តផ្ទៀងផ្ទាត់ប្រសិទ្ធភាពនៃម៉ាកឃ័រទាំងនេះឡើងវិញ មុននឹងយកមកអនុវត្តពេញលេញ។

លទ្ធភាពនៃការអនុវត្ត (Applicability)៖

វិធីសាស្ត្រនៃការរួមបញ្ចូលការវាយតម្លៃកម្រិត NUE ជាមួយនឹងការវិភាគហ្សែនម៉ូលេគុលនេះ មានសក្តានុពលខ្លាំង និងអាចយកមកអនុវត្តបានយ៉ាងល្អសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវដំណាំស្រូវនៅកម្ពុជា។

ជារួម ការអនុវត្តបច្ចេកទេសស្រាវជ្រាវនេះនឹងជួយជំរុញការអភិវឌ្ឍពូជស្រូវកម្ពុជាឱ្យកាន់តែមានផលិតភាពខ្ពស់ សន្សំសំចៃថ្លៃដើមជី និងរួមចំណែកដល់កសិកម្មប្រកបដោយចីរភាព និងមិត្តភាពបរិស្ថាន។

៤. ផែនការសកម្មភាពសម្រាប់និស្សិត (Actionable Roadmap)

ដើម្បីអនុវត្តតាមការសិក្សានេះ និស្សិតគួរអនុវត្តតាមជំហានខាងក្រោម៖

  1. រៀបចំការពិសោធន៍វាយតម្លៃកម្រិត NUE ក្នុងផើង (Phenotypic Evaluation): ដាំដុះពូជស្រូវក្នុងស្រុករបស់កម្ពុជាក្នុងផើងដោយប្រើកម្រិតជីអាសូត ៣ ផ្សេងគ្នា (Zero, Low, Normal) និងប្រើប្រាស់កម្មវិធី IRRISTAT 5.0 វិភាគទិន្នន័យទម្ងន់ស្ងួតរបស់រុក្ខជាតិ ដើម្បីកំណត់រកពូជដែលមានប្រសិទ្ធភាពប្រើប្រាស់អាសូតខ្ពស់បំផុត។
  2. ចម្រាញ់ DNA ពីស្លឹកស្រូវ (DNA Extraction): ប្រមូលស្លឹកស្រូវខ្ចីពីពូជដែលមាន NUE ខ្ពស់និងទាប រួចអនុវត្តពិធីការចម្រាញ់ DNA ដោយប្រើប្រាស់សូលុយស្យុង Potassium acetate-SDS ឱ្យបានត្រឹមត្រូវតាមស្ដង់ដារមន្ទីរពិសោធន៍។
  3. ធ្វើកើនចំនួន DNA និងកំណត់ភាពខុសគ្នានៃហ្សែន (PCR & Polymorphism Detection): រៀបចំប្រតិកម្ម PCR ជាមួយនឹងម៉ាកឃ័រ SSR និង STS ក្នុងម៉ាស៊ីន Thermal Cycler រួចយកផលិតផលទៅរត់លើ Gel Electrophoresis ដើម្បីស្វែងរកម៉ាកឃ័រពហុរូបិយ (Polymorphic markers)។
  4. បង្កើតផែនទីរូបវន្តនៃក្រូម៉ូសូម (Physical Map Construction): យកលំដាប់ DNA នៃម៉ាកឃ័រដែលរកឃើញទៅផ្ទៀងផ្ទាត់ក្នុងឧបករណ៍ BLAST លើមូលដ្ឋានទិន្នន័យ Oryzabase ដើម្បីកំណត់ទីតាំងពិតប្រាកដនៅលើក្រូម៉ូសូមទាំង១២។
  5. ស្រាវជ្រាវរកទីតាំងហ្សែន (QTL Mapping): ប្រើប្រាស់ផែនទីរូបវន្តដែលទទួលបាន ដើម្បីធ្វើការផ្សារភ្ជាប់ទីតាំងហ្សែនបញ្ជាបរិមាណ (QTLs) ទៅនឹងលក្ខណៈកសិកម្ម NUE សម្រាប់អនុវត្តក្នុងកម្មវិធីបង្កាត់ពូជ Marker-Assisted Selection (MAS) នាពេលអនាគត។

៥. វាក្យសព្ទបច្ចេកទេស (Technical Glossary)

ពាក្យបច្ចេកទេស ការពន្យល់ជាខេមរភាសា (Khmer Explanation) និយមន័យសាមញ្ញ (Simple Definition)
Nitrogen-use Efficiency (NUE) (ប្រសិទ្ធភាពនៃការប្រើប្រាស់អាសូត) ជារង្វាស់ដែលបង្ហាញពីសមត្ថភាពរបស់រុក្ខជាតិក្នុងការស្រូបយក និងប្រើប្រាស់ជាតិអាសូតពីដី ឬពីជី ដើម្បីបំលែងទៅជាការលូតលាស់ និងទិន្នផល (ដូចជាគ្រាប់ស្រូវ ឬជីវម៉ាសសរុប)។ ការស្វែងយល់ពីវាជួយក្នុងការជ្រើសរើសពូជដំណាំដែលត្រូវការជីតិច ប៉ុន្តែផ្តល់ផលច្រើន ដែលជួយកាត់បន្ថយការចំណាយ និងការបំពុលបរិស្ថាន។ ដូចជាការវាស់ស្ទង់កម្រិតស៊ីសាំងរបស់រថយន្ត ដោយរថយន្តស៊េរីល្អចាក់សាំងតិចតែអាចរត់បានចម្ងាយឆ្ងាយ (រុក្ខជាតិប្រើជីតិចតែផ្តល់ផលច្រើន)។
Landrace (ពូជក្នុងស្រុក ឬពូជប្រពៃណី) ជាពូជរុក្ខជាតិ ឬសត្វក្នុងស្រុកដែលត្រូវបានកសិករដាំដុះ និងអភិរក្សបន្តគ្នាតាំងពីដូនតាមក ដោយវាបានវិវត្ត និងសម្របខ្លួនយ៉ាងល្អទៅនឹងបរិស្ថាន អាកាសធាតុ និងដីនៅតំបន់ជាក់លាក់ណាមួយដោយមិនមានការបង្កាត់កែច្នៃតាមបែបវិទ្យាសាស្ត្រទំនើប។ ដូចជាមុខម្ហូបប្រចាំគ្រួសារដែលត្រូវបានបន្តវេនពីដូនតា ដោយប្រើប្រាស់គ្រឿងផ្សំ និងរបៀបធ្វើដែលសាកសមបំផុត និងធន់នឹងស្ថានភាពជាក់លាក់នៅក្នុងតំបន់នោះ។
Polymorphism (ពហុរូបិយ ឬភាពប្រែប្រួលនៃហ្សែន) គឺជាការមានទម្រង់ហ្សែន ឬលំដាប់ DNA ខុសៗគ្នាជាច្រើននៅក្នុងចំណោមបុគ្គលនៃប្រភេទរុក្ខជាតិ ឬសត្វតែមួយ ដែលធ្វើឱ្យពួកវាមានលក្ខណៈរូបរាង ឬសមត្ថភាពខុសគ្នា (ឧទាហរណ៍៖ សមត្ថភាពស្រូបយកជី ឬភាពធន់នឹងជំងឺខុសគ្នា)។ ដូចជាមនុស្សក្នុងគ្រួសារតែមួយដែលមានអ្នកខ្លះសក់ត្រង់ និងអ្នកខ្លះសក់រួញ ទោះបីជាពួកគេមានឈាមជ័រតែមួយក៏ដោយ។
Quantitative trait loci (QTL) (ទីតាំងហ្សែនបញ្ជាបរិមាណ) គឺជាផ្នែក ឬទីតាំងជាក់លាក់នៅលើ DNA ដែលមានទំនាក់ទំនង និងជះឥទ្ធិពលទៅលើការកំណត់លក្ខណៈរូបរាង ឬអាកប្បកិរិយាណាមួយរបស់រុក្ខជាតិដែលអាចវាស់វែងជារង្វាស់បាន ដូចជាទម្ងន់ កម្ពស់ កម្រិតទិន្នផល ឬកម្រិតប្រូបស្រូបយកជីអាសូត។ ដូចជាចំណុចពិសេសនៅលើប្លង់សាងសង់ផ្ទះ ដែលជាអ្នកកំណត់ថាបន្ទប់នោះនឹងមានទំហំប៉ុន្មានម៉ែត្រការ៉េ ឬផ្ទះនោះមានកម្ពស់ប៉ុន្មានម៉ែត្រ។
Physical map (ផែនទីរូបវន្តនៃក្រូម៉ូសូម) ជាផែនទីដែលបង្ហាញពីទីតាំងពិតប្រាកដ និងចម្ងាយជាក់ស្តែងរវាងម៉ាកឃ័រ ឬហ្សែននីមួយៗនៅលើក្រូម៉ូសូម ដោយគិតជាឯកតានៃមូលដ្ឋាន DNA (ដូចជា Mega bases - Mb) ដែលជួយសម្រួលដល់ការស្រាវជ្រាវស្វែងរកហ្សែនល្អៗ។ ដូចជាផែនទី Google Maps ដែលបង្ហាញពីទីតាំងពិតប្រាកដនៃផ្ទះនីមួយៗ និងចម្ងាយគិតជាគីឡូម៉ែត្រនៅតាមបណ្តោយផ្លូវមួយយ៉ាងច្បាស់លាស់។
Simple Sequence Repeats (SSR) (ម៉ាកឃ័រ SSR) គឺជាបំណែក DNA ខ្លីៗនៅលើក្រូម៉ូសូមដែលមានការតម្រៀបអក្សរដដែលៗជាច្រើនដង។ ដោយសារចំនួននៃការតម្រៀបដដែលៗនេះមានការប្រែប្រួលពីបុគ្គលមួយទៅបុគ្គលមួយ គេប្រើវាជា "ម៉ាកឃ័រ" ដើម្បីសម្គាល់ និងប្រៀបធៀបភាពខុសគ្នានៃហ្សែនរវាងពូជរុក្ខជាតិផ្សេងៗ។ ដូចជាលេខកូដសម្ងាត់ (ឧទាហរណ៍ ១២៣-១២៣-១២៣) ដែលមនុស្សម្នាក់ៗមានប្រវែងខុសៗគ្នា ដែលវាជួយឱ្យយើងអាចបែងចែកអត្តសញ្ញាណរបស់ពួកគេបានយ៉ាងងាយស្រួល។
Polymerase Chain Reaction (PCR) (ប្រតិកម្ម PCR) ជាបច្ចេកទេសមន្ទីរពិសោធន៍ដែលត្រូវបានប្រើប្រាស់សម្រាប់ថតចម្លង ឬបង្កើនចំនួនបំណែក DNA ជាក់លាក់ណាមួយឱ្យបានរាប់លានដងក្នុងរយៈពេលដ៏ខ្លី ដើម្បីទទួលបានបរិមាណ DNA គ្រប់គ្រាន់ក្នុងការមើល និងយកទៅវិភាគបន្តក្នុងការសិក្សាហ្សែន។ ដូចជាម៉ាស៊ីន Photocopy ដែលអាចថតចម្លងឯកសារមួយសន្លឹកទៅជារាប់ម៉ឺនសន្លឹកក្នុងពេលមួយប៉ព្រិចភ្នែក ដើម្បីចែកជូនអ្នកគ្រប់គ្នាអានបាន។

៦. ប្រធានបទពាក់ព័ន្ធ (Further Reading)

អត្ថបទដែលបានបោះពុម្ពនៅលើ KhmerResearch ដែលទាក់ទងនឹងប្រធានបទនេះ៖

ប្រធានបទ និងសំណួរស្រាវជ្រាវដែលទាក់ទងនឹងឯកសារនេះ ដែលអ្នកអាចស្វែងរកបន្ថែម៖