Original Title: Molecular, C-value and morphological analyses of somaclonal variation in three olive cultivars
Source: doi.org/10.46882/FAFT/1286
Disclaimer: Summary generated by AI based on the provided document. Please refer to the original paper for full scientific accuracy.

ការវិភាគម៉ូលេគុល តម្លៃ C និងរូបសាស្ត្រនៃការប្រែប្រួលសូម៉ាក្លូន (Somaclonal variation) នៅក្នុងពូជអូលីវចំនួនបី

ចំណងជើងដើម៖ Molecular, C-value and morphological analyses of somaclonal variation in three olive cultivars

អ្នកនិពន្ធ៖ Farah Farahani (Islamic Azad University, Qom branch), Reza Yari (Islamic Azad University, Boroujerd Branch), Masoud Sheidai (Shahid Beheshti University)

ឆ្នាំបោះពុម្ព៖ 2021, Frontiers of Agriculture and Food Technology

វិស័យសិក្សា៖ Plant Genetics

១. សេចក្តីសង្ខេបប្រតិបត្តិ (Executive Summary)

បញ្ហា (The Problem)៖ ការសិក្សានេះស៊ើបអង្កេតលើស្ថិរភាពសេនេទិច និងរូបសាស្ត្រនៃពូជអូលីវ (Olea europaea L.) ដែលបានបណ្តុះជាលិកា ដើម្បីស្វែងយល់ពីទំហំ និងធម្មជាតិនៃការប្រែប្រួលសូម៉ាក្លូន (Somaclonal variation) ដែលកើតឡើងក្នុងអំឡុងពេលបណ្តុះបន្ត (Subculturing) រយៈពេលយូរ។

វិធីសាស្ត្រ (The Methodology)៖ អ្នកស្រាវជ្រាវបានវាយតម្លៃពូជអូលីវអ៊ីរ៉ង់ចំនួនបីមុខ ('Zard', 'Roghani', 'Eiks') រហូតដល់ការបណ្តុះបន្តលើកទីប្រាំពីរ ដោយប្រើការវាយតម្លៃរូបសាស្ត្រ ម៉ាកឃ័រម៉ូលេគុល និងការប៉ាន់ស្មានទំហំហ្សែន។

លទ្ធផលសំខាន់ៗ (The Verdict)៖

២. ការវិភាគលើប្រសិទ្ធភាព និងដែនកំណត់ (Performance & Constraints)

វិធីសាស្ត្រ (Method) គុណសម្បត្តិ (Pros) គុណវិបត្តិ (Cons) លទ្ធផលគន្លឹះ (Key Result)
RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) Analysis
ការវិភាគ RAPD (កាត់ដុំ DNA ចៃដន្យដើម្បីរកពហុសណ្ឋាន)
អាចចាប់យកភាពខុសគ្នានៃសេនេទិចកម្រិតម៉ូលេគុល (ការបំប្លែងនុយក្លេអូទីត) បានយ៉ាងច្បាស់លាស់ និងមានប្រសិទ្ធភាពក្នុងការកំណត់អត្តសញ្ញាណរុក្ខជាតិដែលបានបណ្តុះ។ ត្រូវការម៉ាស៊ីន PCR និងសារធាតុគីមីពិសេស ហើយមិនអាចប្រាប់ពីការផ្លាស់ប្តូរបរិមាណ DNA សរុបបានទេ។ បានបង្ហាញពីពហុសណ្ឋាន (Polymorphism) ខ្ពស់ ដែលរុក្ខជាតិពីការបណ្តុះបន្ត (subculture) ចុងក្រោយមានគម្លាតសេនេទិចឆ្ងាយពីដើមមេ។
Flow Cytometry (C-value analysis)
ការវាស់កោសិកាដោយលំហូរ (សម្រាប់ការវិភាគតម្លៃ C)
ផ្តល់លទ្ធផលរហ័ស និងមានភាពច្បាស់លាស់ខ្ពស់ក្នុងការវាស់វែងបរិមាណ DNA សរុបនៅក្នុងកោសិកា ដើម្បីរកមើលការប្រែប្រួលទំហំហ្សែន។ ឧបករណ៍មានតម្លៃថ្លៃខ្លាំង និងតម្រូវឱ្យមានជំនាញបច្ចេកទេសខ្ពស់បំផុតក្នុងការរៀបចំសំណាកកោសិកាជាលិកាស្រស់។ មិនមានការផ្លាស់ប្តូរគួរឱ្យកត់សម្គាល់លើបរិមាណ DNA នុយក្លេអ៊ែរ (មធ្យម ៥.៤១ ទៅ ៥.៤២ pg) ក្នុងចន្លោះពេលបណ្តុះជាលិកាឡើយ។
Morphological Evaluation
ការវាយតម្លៃផ្នែករូបសាស្ត្រ
ងាយស្រួលអនុវត្ត មិនត្រូវការឧបករណ៍ពិសោធន៍ទំនើប និងអាចសង្កេតឃើញការផ្លាស់ប្តូររូបរាងជាក់ស្តែងនៃរុក្ខជាតិ (ដូចជាស្លឹក និងប្រវែងដើម)។ ការផ្លាស់ប្តូររូបរាងមិនតែងតែទាក់ទងដោយផ្ទាល់ទៅនឹងការផ្លាស់ប្តូរសេនេទិចនោះទេ ហើយអាចរងឥទ្ធិពលពីបរិស្ថានខាងក្រៅ។ មានភាពខុសគ្នាយ៉ាងខ្លាំងលើរូបសាស្ត្ររវាងរុក្ខជាតិបណ្តុះបន្ត (subcultures) ប៉ុន្តែមិនមានទំនាក់ទំនងផ្ទាល់ជាមួយថេរវេលានៃការបណ្តុះឡើយ។

ការចំណាយលើធនធាន (Resource Cost)៖ ការសិក្សានេះតម្រូវឱ្យមានការបំពាក់មន្ទីរពិសោធន៍បណ្តុះជាលិកា និងឧបករណ៍វិភាគម៉ូលេគុលកម្រិតខ្ពស់ព្រមទាំងអ្នកជំនាញ។

៣. ការពិនិត្យសម្រាប់បរិបទកម្ពុជា/អាស៊ីអាគ្នេយ៍

ភាពលំអៀងនៃទិន្នន័យ (Data Bias)៖

ការសិក្សានេះត្រូវបានធ្វើឡើងនៅក្នុងប្រទេសអ៊ីរ៉ង់ ដោយប្រើប្រាស់ពូជអូលីវ (Olea europaea) ក្នុងស្រុករបស់ពួកគេដូចជាពូជ Zard, Roghani, និង Eiks។ ទោះបីជាអូលីវមិនមែនជារុក្ខជាតិសេដ្ឋកិច្ចនៅកម្ពុជាក៏ដោយ ប៉ុន្តែវិធីសាស្ត្រក្នុងការតាមដានបម្រែបម្រួលសេនេទិច (Somaclonal variation) នេះមានសារៈសំខាន់ណាស់ ព្រោះវាអាចអនុវត្តបានលើការផលិតកូនរុក្ខជាតិកសិកម្មផ្សេងៗទៀតតាមរយៈការបណ្តុះជាលិកា។

លទ្ធភាពនៃការអនុវត្ត (Applicability)៖

វិធីសាស្ត្រវាយតម្លៃម៉ូលេគុល និងរូបសាស្ត្រទាំងនេះ មានអត្ថប្រយោជន៍យ៉ាងខ្លាំងសម្រាប់ការអភិវឌ្ឍវិស័យកសិកម្មនៅកម្ពុជា ជាពិសេសក្នុងការធានាគុណភាពកូនពូជរុក្ខជាតិ។

ជារួម បច្ចេកវិទ្យាទាំងនេះផ្តល់នូវឧបករណ៍ដ៏មានឥទ្ធិពលដល់វិទ្យាស្ថានស្រាវជ្រាវកម្ពុជា ក្នុងការគ្រប់គ្រងគុណភាព និងការបង្កាត់ពូជដំណាំសេដ្ឋកិច្ចប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាព និងចីរភាព។

៤. ផែនការសកម្មភាពសម្រាប់និស្សិត (Actionable Roadmap)

ដើម្បីអនុវត្តតាមការសិក្សានេះ និស្សិតគួរអនុវត្តតាមជំហានខាងក្រោម៖

  1. សិក្សាពីមូលដ្ឋានគ្រឹះនៃការបណ្តុះជាលិកា: និស្សិតគួរសិក្សាពីរបៀបរៀបចំមជ្ឈដ្ឋានបណ្តុះ (ឧទាហរណ៍៖ MS mediumDKW medium) និងការអនុវត្តបច្ចេកទេសปลอดមេរោគ (Aseptic technique) នៅក្នុងបន្ទប់ពិសោធន៍ ដើម្បីចៀសវាងការចម្លងរោគ។
  2. អនុវត្តបច្ចេកទេសស្រង់ DNA (DNA Extraction): ហ្វឹកហាត់ការស្រង់ DNA ពីរុក្ខជាតិដោយប្រើវិធីសាស្ត្រ Modified CTAB method ដែលជានីតិវិធីស្តង់ដារ និងមានតម្លៃថោកសមរម្យសម្រាប់មន្ទីរពិសោធន៍ក្នុងស្រុក។
  3. រៀនប្រើប្រាស់ម៉ាស៊ីន PCR និងបច្ចេកទេស RAPD: សិក្សាពីការកំណត់សីតុណ្ហភាព និងជុំវដ្តរបស់ម៉ាស៊ីន PCR machine ព្រមទាំងរបៀបអានលទ្ធផលបន្ទះ DNA តាមរយៈការធ្វើ Agarose gel electrophoresis
  4. សិក្សាពីការប្រើប្រាស់កម្មវិធីវិភាគទិន្នន័យជីវសាស្ត្រ: អនុវត្តការប្រើប្រាស់កម្មវិធីកុំព្យូទ័រដូចជា NTSYSPOPGENE ដើម្បីគូរដ្យាក្រាមដើមឈើ (Dendrogram) និងវាស់ស្ទង់គម្លាតសេនេទិចដោយផ្អែកលើទិន្នន័យពី RAPD។
  5. អនុវត្តគម្រោងស្រាវជ្រាវខ្នាតតូចលើដំណាំក្នុងស្រុក: ចាប់ផ្តើមគម្រោងវាយតម្លៃស្ថិរភាពសេនេទិចនៃរុក្ខជាតិបណ្តុះជាលិកាដែលមានស្រាប់នៅកម្ពុជា (ដូចជា កូនចេក ឬ អ័រគីដេ) ដោយប្រើប្រាស់ RAPD markers ដើម្បីប្រៀបធៀបរវាងកូនរុក្ខជាតិ និងដើមមេរបស់វា។

៥. វាក្យសព្ទបច្ចេកទេស (Technical Glossary)

ពាក្យបច្ចេកទេស ការពន្យល់ជាខេមរភាសា (Khmer Explanation) និយមន័យសាមញ្ញ (Simple Definition)
Somaclonal variation (ការប្រែប្រួលសូម៉ាក្លូន) សំដៅលើការប្រែប្រួលនៃសេនេទិច ឬលក្ខណៈរូបសាស្ត្រដែលកើតឡើងលើរុក្ខជាតិដែលបានបណ្តុះចេញពីកោសិកា ឬជាលិកានៅក្នុងមន្ទីរពិសោធន៍ (In vitro) ដែលអាចបង្កឡើងដោយការផ្លាស់ប្តូរទម្រង់ DNA ឬកត្តាអេពីសេនេទិច។ ដូចជាការថតចម្លងឯកសារមួយច្រើនដង ហើយច្បាប់ចម្លងក្រោយៗចាប់ផ្តើមមានស្នាមប្រឡាក់ ឬបាត់តួអក្សរខ្លះៗខុសពីច្បាប់ដើម។
Random amplified polymorphic DNA (RAPD) (បច្ចេកទេសផ្តិតយក DNA ពហុសណ្ឋានចៃដន្យ) ជាបច្ចេកទេសម៉ូលេគុលមួយប្រភេទដែលប្រើប្រាស់ម៉ាស៊ីន PCR និង primer (បំណែកសេនេទិចខ្លីៗ) ដើម្បីចម្លងបំណែក DNA ដោយចៃដន្យ សម្រាប់យកទៅប្រៀបធៀបរកមើលភាពខុសគ្នានៃហ្សែន (Mutations) រវាងសព៌ាង្គកាយ។ ដូចជាការបោះសំណាញ់ចូលទៅក្នុងបឹងដើម្បីចាប់ត្រីដោយចៃដន្យ បើបឹងពីរមានត្រីខុសគ្នា សំណាញ់នឹងចាប់បានប្រភេទត្រីខុសគ្នា ដែលបញ្ជាក់ថាបឹងទាំងពីរនោះមិនដូចគ្នាទេ។
Flow cytometry (ការវាស់កោសិកាដោយលំហូរ) ជាបច្ចេកវិទ្យាសម្រាប់រាប់ និងវិភាគលក្ខណៈរូបវន្ត ឬគីមីនៃកោសិកា ឬភាគល្អិតនីមួយៗ ពេលដែលវាហូរឆ្លងកាត់កាំរស្មីឡាស៊ែរ ដែលនៅក្នុងការសិក្សានេះវាត្រូវបានប្រើដើម្បីវាស់បរិមាណ DNA សរុបនៅក្នុងកោសិកា។ ដូចជាម៉ាស៊ីនស្កេនទំនិញនៅតាមផ្សារទំនើប ដែលអាចអានបាកូដនិងវាស់ទំហំទំនិញនីមួយៗបានយ៉ាងលឿនពេលវារំកិលកាត់ម៉ាស៊ីន។
C-value (តម្លៃ C ឬបរិមាណ DNA សរុប) គឺជាបរិមាណសរុបនៃ DNA នៅក្នុងកោសិកាដែលមានក្រូម៉ូសូមតែមួយឈុត (Haploid nucleus) របស់សព៌ាង្គកាយណាមួយ ដែលវាត្រូវបានប្រើដើម្បីពិនិត្យមើលថាតើមានការបាត់បង់ ឬកើនឡើងទំហំហ្សែនទាំងមូលដែរឬទេ។ ដូចជាទម្ងន់សរុបនៃសៀវភៅមួយក្បាល បើទម្ងន់នៅដដែល មានន័យថាចំនួនទំព័រមិនមានការបាត់បង់ ឬកើនឡើងឡើយ ទោះបីជាអក្សរនៅខាងក្នុងអាចមានការកែប្រែដោយកន្លែងក៏ដោយ។
Subculture (ការបណ្តុះបន្ត) ដំណើរការនៃការផ្ទេរកោសិកា ឬជាលិការុក្ខជាតិពីមជ្ឈដ្ឋានចិញ្ចឹមចាស់ ទៅកាន់មជ្ឈដ្ឋានចិញ្ចឹមថ្មី (Fresh medium) ដើម្បីបន្តការលូតលាស់ និងពង្រីកចំនួនរុក្ខជាតិនៅក្នុងមន្ទីរពិសោធន៍។ ដូចជាការដកកូនរុក្ខជាតិដែលដុះញឹកពេកនៅក្នុងផើងតូចមួយ ទៅដាំបំបែកក្នុងផើងថ្មីធំជាងមុន ដើម្បីឱ្យវាមានជីជាតិគ្រប់គ្រាន់អាចលូតលាស់បន្តបាន។
Polymorphic (ពហុសណ្ឋាន) វត្តមាននៃទម្រង់ហ្សែន ឬលក្ខណៈខុសៗគ្នាច្រើននៅក្នុងចំណោមប្រភេទរុក្ខជាតិ ឬសត្វតែមួយ ដែលបង្ហាញពីភាពចម្រុះនៃ DNA បន្ទាប់ពីឆ្លងកាត់ការបណ្តុះជាលិកា។ ដូចជារថយន្តម៉ាកតែមួយ និងម៉ូដែលតែមួយ ប៉ុន្តែមានពណ៌និងការតុបតែងខុសៗគ្នាទៅតាមចំណង់ចំណូលចិត្តរបស់អ្នកប្រើប្រាស់។
Internode cuttings (ការកាត់ចន្លោះថ្នាំង) ការកាត់យកផ្នែកនៃដើមរុក្ខជាតិដែលនៅចន្លោះថ្នាំងពីរ (កន្លែងដែលស្លឹកដុះចេញ) ដើម្បីយកទៅប្រើប្រាស់ជាសំណាក (Explant) សម្រាប់ការបណ្តុះជាលិកាបង្កើតជារុក្ខជាតិថ្មី។ ដូចជាការកាត់យកតួបំពង់ទុយោជ័រនៅចន្លោះគន្លាក់តភ្ជាប់ពីរ ដើម្បីយកទៅប្រើប្រាស់ជាវត្ថុធាតុដើមក្នុងការបង្កើតជារបស់អ្វីមួយផ្សេងទៀត។

៦. ប្រធានបទពាក់ព័ន្ធ (Further Reading)

អត្ថបទដែលបានបោះពុម្ពនៅលើ KhmerResearch ដែលទាក់ទងនឹងប្រធានបទនេះ៖

ប្រធានបទ និងសំណួរស្រាវជ្រាវដែលទាក់ទងនឹងឯកសារនេះ ដែលអ្នកអាចស្វែងរកបន្ថែម៖